Effects of substituents on the 5-position of deoxyuridinemonophosphate on the thiolate addition in thymidylate synthase using QM/MM technique
ไทมิดิเลตซินเทสเป็นเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาการเติมหมู่เมทิลแบบรีดิวซ์ของของสารดียูเอ็มพีเพื่อสร้างผลิตภัณฑ์ดีทีเอ็มพีในกระบวนการสังเคราะห์ไทมีนนิวคลีโอไทด์ การเติมแบบไมเคิลและการเกิดสารเชิงซ้อนโควาเลนต์ไตรภาคถูกพิจารณาว่าเป็นขั้นตอนที่มีความสำคัญที่ถูกรวมอยู่ในขั้นกลไกการยับยั้งของยาต่อต้านมะเร็งห้าเ...
محفوظ في:
| المؤلف الرئيسي: | |
|---|---|
| مؤلفون آخرون: | |
| التنسيق: | Theses and Dissertations |
| اللغة: | English |
| منشور في: |
Chulalongkorn University
2012
|
| الموضوعات: | |
| الوصول للمادة أونلاين: | https://digiverse.chula.ac.th/Info/item/dc:37539 |
| الوسوم: |
إضافة وسم
لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!
|
| المؤسسة: | Chulalongkorn University |
| اللغة: | English |
| الملخص: | ไทมิดิเลตซินเทสเป็นเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาการเติมหมู่เมทิลแบบรีดิวซ์ของของสารดียูเอ็มพีเพื่อสร้างผลิตภัณฑ์ดีทีเอ็มพีในกระบวนการสังเคราะห์ไทมีนนิวคลีโอไทด์ การเติมแบบไมเคิลและการเกิดสารเชิงซ้อนโควาเลนต์ไตรภาคถูกพิจารณาว่าเป็นขั้นตอนที่มีความสำคัญที่ถูกรวมอยู่ในขั้นกลไกการยับยั้งของยาต่อต้านมะเร็งห้าเอฟยู ผลของการแทนที่หมู่ฟังก์ชันที่ตำแหน่งซีห้าของสารดียูเอ็มสับสเตรตด้วยอะตอมฮาโลเจน (ฟลูออรีน,คลอรีนและโบรมีน) หมู่ดึงอิเล็กตรอน (ไซยาไนด์และไนโตร) และหมู่ให้อิเล็กตรอน (อะมิโนและไฮดรอกซีล) ต่อความเสถียรของเอนไซม์ไทมิดิเลตซินเทสถูกสืบสวนโดยใช้เทคนิคการจำลองพลวัติเชิงโมเลกุล ผลการจำลองแสดงให้เห็นว่าพันธะไฮโดรเจนมีการปรากฏเพิ่มขึ้นระหว่างหมู่แทนที่ของสารอุปมานดียูเอ็มพี (ในระบบฟลูออรีนดียูเอ็มพี,ไซยาไนด์ดียูเอ็มพี,ไฮดรอกซิลดียูเอ็มพีและอะมิโนดียูเอ็มพี) และหมู่ไฮดรอกซิลของวายเก้าสิบสี่ พลังงานเสรีการยึดจับได้กำหนดการเรียงลำดับของสัมพรรคภาพการยึดจับได้เป็น คลอรีนดียูเอ็มพี ~ ฟลูออรีนดียูเอ็มพี > ดียูเอ็มพี > โบรมีนดียูเอ็มพี สำหรับสารอุปมานฮาโลเจน และ ไซยาไนด์ดียูเอ็มพี ~ ไนโตรดียูเอ็มพี > ไฮดรอกซิลดียูเอ็มพี ~ อะมิโนดียูเอ็มพี สำหรับสารอุปมานแบบดึงอิเล็กตรอนและให้อิเล็กตรอน บนพื้นฐานวิธีไฮบริด B3LYP/6-31+G*-CHARMM การเติมแบบไมเคิลและการเกิดสารเชิงซ้อนโควาเลนต์ไตรภาคระหว่างดียูเอ็มพีและเอ็มทีเอชเอฟสับสเตรตเพื่อเกิดเป็นสารมัธยันตร์สะพานเมทิลีนพบว่าเกิดผ่านกลไกแบบคอนเซิดเต็ด จากการทดสอบเทคนิคคิวเอ็ม/เอ็มเอ็ม ในหลายลักษณะงานวิจัยนี้ได้เลือกใช้เทคนิค SCS-MP2 ด้วย aug-cc-pVTZ เบซิส เซ็ต สำหรับการคำนวณหาค่าพลังงานการเกิดปฏิกิริยา เนื่องจากสัมพรรคภาพในการยึดจับที่สูงและใช้พลังงานก่อกัมมันต์ใกล้เคียงกับยาต่อต้านมะเร็งฟลูออรีนดียูเอ็มพีดังนั้นเราจึงนำเสนอว่าสารอุปมานคลอรีนดียูเอ็มพีมีศักยภาพที่จะเป็นสารยับยั้งต่อต้านฟังก์ชันของเอนไซม์ไทมิดิเลตซินเทสได้ |
|---|