VALIDASI PREDIKSI MUTAGENISITAS AMES MENGGUNAKAN ENAM MODEL BERBEDA PADA PERANGKAT LUNAK VEGA

• Main Author: M. F. Putri Radityo, Fasya
• Format: Final Project
• Language: Indonesia
• Online Access: https://digilib.itb.ac.id/gdl/view/82609
• Institution: Institut Teknologi Bandung

Mutagenisitas adalah salah satu titik akhir yang paling populer untuk mengevaluasi genotoksisitas bahan kimia. Mutagen adalah bahan kimia yang menyebabkan mutasi genetik pada manusia. Hal ini dapat diperiksa dengan menggunakan uji Ames. Namun, saat ini, ada sejumlah model mutagenisitas untuk menilai mutagenisitas bahan kimia hanya dengan menggunakan nomor SMILES dan struktur kimia. Untuk mengetahui pemodelan mutagenisitas terbaik di antara model CONSENSUS, model CAESAR, model ISS, model SarPy, model KNN, dan model CONCERT (aromatik amina), sekitar 690 bahan kimia dikumpulkan dalam sebuah basis data untuk dianalisa dan dihitung metrik kinerjanya. Prediksi ini divalidasi berdasarkan berbagai parameter termasuk akurasi, balanced accuracy, Koefisien Korelasi Matthew, kecakupan, sensitivitas, selektivitas, nilai prediksi positif, nilai prediksi negatif. Berdasarkan hasil yang diperoleh dalam penelitian ini, dapat disimpulkan bahwa model KNN memiliki kemampuan prediksi terbaik untuk mutagenisitas, yang dibenarkan oleh metrik kinerja yang dilakukan untuk masing-masing model.