KERAGAMAN GENETIK Peronosclerospora spp. YANG MENYERANG TANAMAN JAGUNG DI INDONESIA MENGGUNAKAN PENANDA MlKROSATELIT DAN AMPLIFIED RIBOSOMAL DNA RESTRICTION ANALYSIS (ARDRA)
Peronosclerospora spp. mempakan penycbab penyakil bulai yang dapal menimbulkan kerusakan parah pada tanaman jagung yang bersifal rentan Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragarmlll I:!cnetik Perul?osc/ero.'1)orl:'roll()sc/ermj7()/'{/ spp. herdasarkall penggabtUlgan dendogram...
Saved in:
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Theses and Dissertations NonPeerReviewed |
| Language: | Indonesian |
| Published: |
2012
|
| Subjects: | |
| Online Access: | http://repository.unair.ac.id/37424/1/gdlhub-gdl-s2-2013-afiflfudin-27554-tk01-12-k.pdf http://repository.unair.ac.id/37424/ http://lib.unair.ac.id |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Institution: | Universitas Airlangga |
| Language: | Indonesian |
| Summary: | Peronosclerospora spp. mempakan penycbab penyakil bulai yang dapal menimbulkan kerusakan parah pada tanaman jagung yang bersifal rentan Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragarmlll I:!cnetik Perul?osc/ero.'1)orl:'roll()sc/ermj7()/'{/ spp. herdasarkall penggabtUlgan dendogram mikrosatelit dan ARDRA Isolat yang ciiujl berasal dall 5 provinsi di Indonesia yaitu Jawa Barat, .lawa Tengah, Jawa Timur. Lampullt' dan Gorontalo. Amplifikasi mengf:,'11I1akan penanda mikrosatelit mcngllasilkan 1% aIel yang teridentifikasi di 40 lokus mikrosatelit dcngan ukuran anlara 60-560 pI; Amplifikasi daerah ITSI-5.8S-ITS2 dan DI-D::! 28S rUNA lllcnghasilkall amplikon dengan ukuran ±]200 ph. Anuhsis restriksi amplikon rD!,/ dcngan () enzim restIiksi yang berbeda, AluL .'iuII96L Hue iII, MhoL ,"'ell dan menghasilkan 37 pola restriksi. Perbcdaan jumlah dan ukuran aiel an!ar isolat til berbagai lokus mikrosatelit dan pola restriksi fi'agmcn ARDRA dari .i I isulat Peronosclero.<,pora spp. yang bersifat ullik menllnjukkan keragaman genetik alltar isolat yang dikoleksi. Berdasarkan kOllstrnksi dendogram dari fi'a!:,'111cn D . i mikrosatelit dan ARDRA memperlihalkan balnva isolat Penll/o.c/ef'Us{Jom spp terpisah menjadi 3 kluster dengan kemiripan gCllctik an tar Isola! berkisar 66-9XH" tUltuk mikrosatelit dan 58-100% un!nk ARDRA Pcrbandmgan dendogram antat isolat di 1 provinsi menunjukkan bahwa kcmiripan genetik antar isola! dan mikrosatelit sedikit lebih rendah dari ARDRA sehingga mikrosatelit relatif lcblll diskriminatif daripada ARDRA. Selain illt analtsa kInsler berdasarkan gahungall data kedua penanda, kemiripan genetik antar isolat herkisar antara 64-<)g 0" dimana pembagian kluster yang terhentuk kecendcrungan mengikltti penalltia mikrosatelit. |
|---|