KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER
Indonesia memiliki biodiversitas laut yang cukup tinggi termasuk teripang. Tujuh spesies teripang telah dilaporkan keberadaannya di kawasan Pantai Timur Surabaya salah satunya Colochirus sp., namun posisi taksonomi spesimen tersebut masih belum terkonfirmasi secara molekuler. Penelitian ini bertu...
Saved in:
Main Author: | |
---|---|
Format: | Theses and Dissertations NonPeerReviewed |
Language: | Indonesian Indonesian |
Published: |
2018
|
Subjects: | |
Online Access: | http://repository.unair.ac.id/78105/1/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20ABSTRAK.pdf http://repository.unair.ac.id/78105/2/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20SKRIPSI.pdf http://repository.unair.ac.id/78105/ http://lib.unair.ac.id |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
Institution: | Universitas Airlangga |
Language: | Indonesian Indonesian |
id |
id-langga.78105 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
id-langga.781052019-01-10T08:16:01Z http://repository.unair.ac.id/78105/ KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065 SF409 Small animal culture Indonesia memiliki biodiversitas laut yang cukup tinggi termasuk teripang. Tujuh spesies teripang telah dilaporkan keberadaannya di kawasan Pantai Timur Surabaya salah satunya Colochirus sp., namun posisi taksonomi spesimen tersebut masih belum terkonfirmasi secara molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesimen yang diduga Colochirus sp. dengan pendekatan morfologi eksternal maupun internal tubuh dan mengkonfirmasi secara genetik dengan sekuen gen DNA mitokondria COI (Cytochrome Oxidase Subunit I) menggunakan primer COIce. Hasil dari identifikasi morfologi maupun anatomi internal spesimen tersebut identik dengan spesies Colochirus quadrangularis Troschel, 1846 sebagaimana dideskripsi oleh O’Loughlin et al. (2016) dan analisa sekuen DNA juga memiliki kesamaan dengan DNA Colochirus quadrangularis dari data base Genbank. Nilai kesamaan identity dari ketiga DNA spesimen tersebut sebesar 97-99% dengan nilai perbedaan sebesar 1-3%. Nilai perbedaan tersebut tidak melebihi ambang batas perbedaan yaitu 2-3%, sehingga spesimen tersebut merupakan spesies yang sama Colochirus quadrangularis Troschel, 1846. Pada konstruksi hubungan kekerabatan menggunakan software MEGA diketahui bahwa ketiga sampel berkerabat dekat dengan spesimen Colochirus quadrangularis Troschel, 1846 yang terdapat pada wilayah perairan Singapura dan Australia bagian utara. Dengan demikian, posisi taksonomi spesimen tersebut berdasarkan pendekatan morfologi dan molekuler terkonfirmasi sebagai spesies Colochirus quadrangularis Troschel, 1846. 2018 Thesis NonPeerReviewed text id http://repository.unair.ac.id/78105/1/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20ABSTRAK.pdf text id http://repository.unair.ac.id/78105/2/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20SKRIPSI.pdf ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065 (2018) KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER. Skripsi thesis, Universitas Airlangga. http://lib.unair.ac.id |
institution |
Universitas Airlangga |
building |
Universitas Airlangga Library |
country |
Indonesia |
collection |
UNAIR Repository |
language |
Indonesian Indonesian |
topic |
SF409 Small animal culture |
spellingShingle |
SF409 Small animal culture ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065 KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER |
description |
Indonesia memiliki biodiversitas laut yang cukup tinggi termasuk teripang.
Tujuh spesies teripang telah dilaporkan keberadaannya di kawasan Pantai Timur
Surabaya salah satunya Colochirus sp., namun posisi taksonomi spesimen tersebut
masih belum terkonfirmasi secara molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk
mengidentifikasi spesimen yang diduga Colochirus sp. dengan pendekatan
morfologi eksternal maupun internal tubuh dan mengkonfirmasi secara genetik
dengan sekuen gen DNA mitokondria COI (Cytochrome Oxidase Subunit I)
menggunakan primer COIce. Hasil dari identifikasi morfologi maupun anatomi
internal spesimen tersebut identik dengan spesies Colochirus quadrangularis
Troschel, 1846 sebagaimana dideskripsi oleh O’Loughlin et al. (2016) dan analisa
sekuen DNA juga memiliki kesamaan dengan DNA Colochirus quadrangularis
dari data base Genbank. Nilai kesamaan identity dari ketiga DNA spesimen tersebut
sebesar 97-99% dengan nilai perbedaan sebesar 1-3%. Nilai perbedaan tersebut
tidak melebihi ambang batas perbedaan yaitu 2-3%, sehingga spesimen tersebut
merupakan spesies yang sama Colochirus quadrangularis Troschel, 1846. Pada
konstruksi hubungan kekerabatan menggunakan software MEGA diketahui bahwa
ketiga sampel berkerabat dekat dengan spesimen Colochirus quadrangularis
Troschel, 1846 yang terdapat pada wilayah perairan Singapura dan Australia bagian
utara. Dengan demikian, posisi taksonomi spesimen tersebut berdasarkan
pendekatan morfologi dan molekuler terkonfirmasi sebagai spesies Colochirus
quadrangularis Troschel, 1846. |
format |
Theses and Dissertations NonPeerReviewed |
author |
ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065 |
author_facet |
ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065 |
author_sort |
ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065 |
title |
KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER |
title_short |
KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER |
title_full |
KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER |
title_fullStr |
KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER |
title_full_unstemmed |
KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER |
title_sort |
kajian taksonomi colochirus sp. di kawasan pantai timur surabaya berdasarkan pendekatan morfologi dan genetika molekuler |
publishDate |
2018 |
url |
http://repository.unair.ac.id/78105/1/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20ABSTRAK.pdf http://repository.unair.ac.id/78105/2/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20SKRIPSI.pdf http://repository.unair.ac.id/78105/ http://lib.unair.ac.id |
_version_ |
1681150884482908160 |