KAJIAN TAKSONOMI Colochirus sp. DI KAWASAN PANTAI TIMUR SURABAYA BERDASARKAN PENDEKATAN MORFOLOGI DAN GENETIKA MOLEKULER

• Main Author: ALVI JAUHAROTUS SYUKRIYA, 081411431065
• Format: Theses and Dissertations NonPeerReviewed
• Language: Indonesian; Indonesian
• Published: 2018
• Subjects: SF409 Small animal culture
• Online Access: http://repository.unair.ac.id/78105/1/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20ABSTRAK.pdf; http://repository.unair.ac.id/78105/2/KKC%20KK%20MPB.21-18%20Syu%20k%20SKRIPSI.pdf; http://repository.unair.ac.id/78105/; http://lib.unair.ac.id
• Institution: Universitas Airlangga

Indonesia memiliki biodiversitas laut yang cukup tinggi termasuk teripang. Tujuh spesies teripang telah dilaporkan keberadaannya di kawasan Pantai Timur Surabaya salah satunya Colochirus sp., namun posisi taksonomi spesimen tersebut masih belum terkonfirmasi secara molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesimen yang diduga Colochirus sp. dengan pendekatan morfologi eksternal maupun internal tubuh dan mengkonfirmasi secara genetik dengan sekuen gen DNA mitokondria COI (Cytochrome Oxidase Subunit I) menggunakan primer COIce. Hasil dari identifikasi morfologi maupun anatomi internal spesimen tersebut identik dengan spesies Colochirus quadrangularis Troschel, 1846 sebagaimana dideskripsi oleh O’Loughlin et al. (2016) dan analisa sekuen DNA juga memiliki kesamaan dengan DNA Colochirus quadrangularis dari data base Genbank. Nilai kesamaan identity dari ketiga DNA spesimen tersebut sebesar 97-99% dengan nilai perbedaan sebesar 1-3%. Nilai perbedaan tersebut tidak melebihi ambang batas perbedaan yaitu 2-3%, sehingga spesimen tersebut merupakan spesies yang sama Colochirus quadrangularis Troschel, 1846. Pada konstruksi hubungan kekerabatan menggunakan software MEGA diketahui bahwa ketiga sampel berkerabat dekat dengan spesimen Colochirus quadrangularis Troschel, 1846 yang terdapat pada wilayah perairan Singapura dan Australia bagian utara. Dengan demikian, posisi taksonomi spesimen tersebut berdasarkan pendekatan morfologi dan molekuler terkonfirmasi sebagai spesies Colochirus quadrangularis Troschel, 1846.