Phylogenetic Analysis and Anti Microbial Activity of Streptomyces spp. Isolated From Compost Soil in Surabaya Indonesia on The Basis of 16S Rrna Gene

• Main Authors: Rochmah Kurnijasanti, NIDN. 0019077004, Isnaeni, NIDN. 0013015603, Poernomo AT, SA Sudjarwo
• Format: Article PeerReviewed
• Language: English; English
• Published: GRAMIK ( Graha Masyarakat Ilmiah Kedokteran ) 2017
• Subjects: SF780.2-780.7 Veterinary microbiology, bacteriology, virology, mycology; SF910 Other diseases and conditions
• Online Access: http://repository.unair.ac.id/86107/2/Bukti%20C%2010%20Phylogenetic%20Analysis%20and%20Anti%20.....pdf; http://repository.unair.ac.id/86107/1/Peer%20Review%20Bukti%20C10.pdf; http://repository.unair.ac.id/86107/; https://e-journal.unair.ac.id/FMI/article/view/6456
• Institution: Universitas Airlangga

Delapan isolat Streptomyces sp. dapat diisolasi dari tanah kompos di Surabaya, Indonesia. Hasil uji biokimia dan morfologi menunjukkan bahwa 8 isolat tersebut merupakan isolat baru. Analisis filogenetik dilakukan berdasarkan sekuen gen 16S rRNA. Sekuen nukleotida dari gen 16S rRNA Streptomyces sp. isolat tanah kompos Surabaya dianalisis dan dibandingkan dengan sekuen gen 16S rRNA dari pustaka. Hasil analisis Streptomyces sp. isolat tanah kompos Surabaya berdasarkan gen 16S rRNA menunjukkan Streptomyces spesies baru. Hasil diagram pohon filogenetik menunjukkan bahwa Streptomyces Sp-D, Sp-Ep, Sp-G dan Sp-I yang ditemukan pada tanah rumah kompos Bratang Surabaya ternyata merupakan isolat baru. Streptomyces Sp-Ep merupakan Streptomyces jenis baru yang masih berkerabat dekat dengan Streptomyces indonesiasis dan Streptomyces nashvillensis. Streptomyces Sp-Ea merupakan Streptomyces olivoreticuli yang masih berkerabat dengan Streptomyces yogyakartensis. Streptomyces Sp-F adalah Streptomyces levis strain NRRL B-24299. Streptomyces Sp-C adalah Streptomyces filamentosus. Streptomyces Sp-D merupakan Streptomyces jenis baru yang masih berkerabat dekat dengan Streptomyces javensis dan Streptomyces roseus. Streptomyces Sp-G merupakan Streptomyces jenis baru yang masih berkerabat dekat dengan Streptomyces roseoviridis strain NBRC 12911 dan Streptomyces thermocarboxydovorans strain AT52. Streptomyces Sp-I merupakan Streptomyces jenis baru yang masih berkerabat dekat dengan Streptomyces cangkringensis dan Streptomyces asiaticus. Streptomyces Sp-A adalah Streptomyces laurentii strain : LMG 19959. (FMI 2017;53:204-208) Kata kunci: analisis filogenetik; antimikrobial; streptomises; tanah kompos; 16S rRNA