Nghiên cứu tạo aptamer đặc hiệu vi khuẩn Escherichia coli O157:H7

• Main Author: Nguyễn, Thanh Thủy
• Other Authors: Lã, Thị Huyền
• Format: Theses and Dissertations
• Language: Vietnamese
• Published: 2020
• Subjects: Vi sinh vật học; Vi khuẩn; Aptamer; 579.3
• Online Access: http://repository.vnu.edu.vn/handle/VNU_123/74396
• Institution: Vietnam National University, Hanoi

Aptamer có bản chất là axit oligonucleic hoặc các phân tử peptide liên kết với một phân tử đích cụ thể. Aptamer được phát hiện từ năm 1990 bởi 2 phòng thí nghiệm độc lập (Ellington & Szostak; Tuerk & Gold). Aptamer là sợi đơn oligonucleotide, cấu trúc cuộn xoắn ba chiều, có khả năng liên kết chặt chẽ và chọn lọc phân tử đích. Trong một số trường hợp vai trò như đầu dò nhận biết phân tử, aptamer có ái lực liên kết thậm chí vượt qua các kháng thể đơn dòng. Các đích của aptamer rất đa dang từ mức độ ion, phân tử, đại phân tử tới tế bào. Quy trình SELEX sàng lọc aptamer điển hình gồm ba quá trình: Chọn lọc những trình tự oligonucleotit (aptamer) gắn với phân tử đích; Loại bỏ nhứng aptamer không gắn hoặc gắn không đặc hiệu với phân tử đích; Thu nhận và khuếch đại những aptamer gắn kết đặc hiệu với vi khuẩn E.coli O157:H7. Và kết quả đạt được: Đã xây dựng được quy trình sàng lọc aptamer ssDNA đặc hiệu E. coli O157:H7 và lựa chọn được một aptamer có ái lực liên kết khá cao với vi khuẩn E. coli O157:H7; Đã tách dòng, xác định trình tự, dự đoán cấu trúc bậc 2 và phân tích cấu trúc của aptamer ssDNA 8. Kết quả cho thấy aptamer ssDNA 8 có chiều dài 72 nucleotid với 2 vùng hoạt động: vùng 1 trong khoảng nucleotid 21-28, vùng 2 trong khoảng 43-57 và trình tự là: 1 ATACGGGAGC CAACACCAAC CACACCAACC GGACGCTTAT GCCTTGCCAT 51 CTACAGAGCA GGTGTGACGG ATA