Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus
Thesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2009
Saved in:
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Theses and Dissertations |
Language: | English |
Published: |
Chulalongkorn University
2012
|
Subjects: | |
Online Access: | http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/16640 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
Institution: | Chulalongkorn University |
Language: | English |
id |
th-cuir.16640 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
th-cuir.166402012-02-04T04:25:21Z Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus การจำแนกในระดับโมเลกุล วิวัฒนาการ และการศึกษาการติดเชื้อข้ามสายพันธุ์ในหนูตัดต่อพันธุกรรม ที่มีการเจริญของเซลล์ตับจากมนุษย์ของไวรัสตับอักเสบ บี ในชะนีและอุรังอุตัง Pattaratida Sa-nguanmoo Yong Poovorawan Chulalongkorn University. Graduate School Hepatitis B virus Hepatitis B virus -- Transmission Thesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2009 Hepatitis B virus does not only exclusively infect humans, but also can be found in non-human primates. The genome organization of non-human primate HBV is nearly identical to that human HBV. There are the data on cross-species transmission of human HBVs to the non-human primates. However, a cross-species transmission of HBVs from non-human primates to human has not been yet been elucidated. One hundred and four non-human primates comprising 12 species were subjected to screen for the serological HBsAg, anti-HBs and anti-HBc markers. Subsequently, HBV DNA detection, whole genome characterization, phylogenetic analysis and evolution study were evaluated and analyzed. The cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency (SCID) mice with human hepatocytes was performed. HBV infection was detected in gibbon (5/25) and orangutan (7/54). Phylogenetic analysis was performed and analyzed. The gibbon and orangutan viruses clustered within their respective groups. Evolutionary study revealed that the population growth rate of non-human primate HBV started a rapid increase in the effective population size around year 1750 to 1850. GiHBV was occurred before OuHBV and has evolutionary rate approximately 10[superscript -4] subs/site/year. OuHBV and GiHBV can replicate in chimeric SCID mice with human hepatocytes. The results showed indirect evidence of cross-species transmission of non-human primate to human could be occurred. ไวรัสตับอักเสบ บี นอกจากพบในมนุษย์แล้วยังสามารถพบได้ในสัตว์จำพวก non-human primate ด้วย เนื่องจากจีโนมมีความใกล้เคียงกับไวรัสในมนุษย์ มีการศึกษาพบว่าไวรัสตับอักเสบ บี จากมนุษย์ สามารถถ่ายทอดไปสู่ non-human primate ได้ อย่างไรก็ตาม ยังไม่มีรายงานการติดต่อข้ามของไวรัสตับอักเสบ บี จากสัตว์ไปสู่มนุษย์ การศึกษาครั้งนี้ได้ตรวจสอบ HBsAg anti-HBs และ anti-HBc ใน non-human primate จำนวน 104 ตัว รวม 12 สปีชีส์ นอกจากนี้ได้ตรวจสอบดีเอ็นเอ หาลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งหมด วิเคราะห์ phylogenetic tree วิวัฒนาการและทดสอบการติดเชื้อข้ามสายพันธุ์ในหนูตัดต่อพันธุกรรม ที่มีการเจริญของเซลล์ตับจากมนุษย์ จากการตรวจสอบพบชะนี 5 ใน 25 ตัวและอุรังอุตัง 7 ใน 54 ตัวเป็นพาหะของไวรัสตับอักเสบ บี ผลการศึกษา phylogenetic tree แสดงให้เห็นว่า ไวรัสตับอักเสบ บี จากชะนีและอุรังอุตังจับกลุ่มกันในสปีชีส์ของตนเอง การศึกษาวิวัฒนาการพบว่า ไวรัสตับอักเสบ บี ใน non-human primate มีการเพิ่มขึ้นของ population growth rate อย่างรวดเร็วในราวปี ค.ศ. 1750-1850 จากการวิเคราะห์พบว่าไวรัสตับอักเสบ บี ในชะนีเกิดขึ้นก่อน ไวรัสตับอักเสบ บี ในอุรังอุตัง และมี evolutionary rate ประมาณ 10-4 subs/site/year การทดสอบการติดเชื้อข้ามสายพันธุ์พบว่า ไวรัสตับอักเสบ บี จากอุรังอุตังและชะนีสามารถเพิ่มจำนวนในหนูทดลองที่มีเซลล์ตับของมนุษย์ได้ ผลการศึกษาบ่งบอกทางอ้อมว่าไวรัสตับอักเสบ บี จากสัตว์จำพวก non-human primate สามารถถ่ายทอดไปสู่มนุษย์ได้ 2012-02-04T04:25:20Z 2012-02-04T04:25:20Z 2009 Thesis http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/16640 en Chulalongkorn University 4056827 bytes application/pdf application/pdf Chulalongkorn University |
institution |
Chulalongkorn University |
building |
Chulalongkorn University Library |
country |
Thailand |
collection |
Chulalongkorn University Intellectual Repository |
language |
English |
topic |
Hepatitis B virus Hepatitis B virus -- Transmission |
spellingShingle |
Hepatitis B virus Hepatitis B virus -- Transmission Pattaratida Sa-nguanmoo Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus |
description |
Thesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2009 |
author2 |
Yong Poovorawan |
author_facet |
Yong Poovorawan Pattaratida Sa-nguanmoo |
format |
Theses and Dissertations |
author |
Pattaratida Sa-nguanmoo |
author_sort |
Pattaratida Sa-nguanmoo |
title |
Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus |
title_short |
Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus |
title_full |
Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus |
title_fullStr |
Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus |
title_full_unstemmed |
Molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis B virus |
title_sort |
molecular characterization, evolution and cross-species transmission study in severe combined immunodeficiency transgenic mice with human hepatocytes of gibbon and orangutan hepatitis b virus |
publisher |
Chulalongkorn University |
publishDate |
2012 |
url |
http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/16640 |
_version_ |
1681408791257546752 |