Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon

Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon

Thesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2010

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Pasapong Poolpipat
Other Authors: Kuakarun Krusong
Format: Theses and Dissertations
Language:English
Published: Chulalongkorn University 2013
Subjects:
Peptide antibiotics
Penaeus monodon
Crystallization
เปปไทด์ต้านจุลชีพ
กุ้งกุลาดำ
การตกผลึก
Online Access:http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/36358
http://doi.org/10.14457/CU.the.2010.880
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Institution: Chulalongkorn University
Language: English
id th-cuir.36358
record_format dspace
institution Chulalongkorn University
building Chulalongkorn University Library
continent Asia
country Thailand
Thailand
content_provider Chulalongkorn University Library
collection Chulalongkorn University Intellectual Repository
language English
topic Peptide antibiotics
Penaeus monodon
Crystallization
เปปไทด์ต้านจุลชีพ
กุ้งกุลาดำ
การตกผลึก
spellingShingle Peptide antibiotics
Penaeus monodon
Crystallization
เปปไทด์ต้านจุลชีพ
กุ้งกุลาดำ
การตกผลึก
Pasapong Poolpipat
Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
description Thesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2010
author2 Kuakarun Krusong
author_facet Kuakarun Krusong
Pasapong Poolpipat
format Theses and Dissertations
author Pasapong Poolpipat
author_sort Pasapong Poolpipat
title Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
title_short Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
title_full Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
title_fullStr Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
title_full_unstemmed Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
title_sort binding properties and crystallization of crustinpm1 and crustinpm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon
publisher Chulalongkorn University
publishDate 2013
url http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/36358
http://doi.org/10.14457/CU.the.2010.880
_version_ 1724630123038113792
spelling th-cuir.363582019-09-02T04:11:37Z Binding properties and crystallization of crustinPm1 and crustinPm7 from tha black tiger shrimp penaeus monodon สมบัติการจับและการตกผลึกของ crustin Pm1 และ crustin Pm7 ของกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon Pasapong Poolpipat Kuakarun Krusong Anchalee Tassanakajon Chulalongkorn University. Faculty of Science Peptide antibiotics Penaeus monodon Crystallization เปปไทด์ต้านจุลชีพ กุ้งกุลาดำ การตกผลึก Thesis (M.Sc.)--Chulalongkorn University, 2010 Crustin is one of several antimicrobial peptides (AMPs) in innate immune system of crustacean. In previous study, crustinPm1 strongly inhibited gram-positive bacteria, whilst crustinPm7 acted against both gram-positive and gram-negative bacteria. The aim of this study is to investigate (1) Binding properties of rcrustinPm1 and rcrustinPm7 to bacterial cells and cell wall components, lipoteichoic acid (LTA) and lipopolysaccharide (LPS) (2) Induction of bacterial agglutination by rcrustinPms (3) Inner membrane permeabilization (4) Effects of rcrustinPms on bacteria cells and (5) Crystallization of rcrustinPms. In this study, the recombinant crustinPm1 and crustinPm7 were produced in Escherichia coli and purified under denaturing condition. The purified rcrustinPms were then renatured and used in antimicrobial activity test. Binding study suggested that both crustin isoforms can bind to both gram-positive and gram-negative bacteria, as well as cell wall components LTA and LPS. CrustinPms can induce bacterial agglutination in some strains of bacteria. They can also change inner membrane permeability of E. coli strain MG1655, resulting in cytoplasmic -galactosidase release. Scanning Electron Microscopy (SEM) revealed physical change on cell surface of Staphylococcus aureus, Vibrio harveyi and E. coli treated with rcrustinPm7. Recombinant crustinPm1; however, can cause physical changes on cell surface of S. aureus and E. coli only. Crystallization experiments were carried out. Recombinant crustinPm1 was crystallized in 0.2 M Lithium citrate tribasic tetrahydrate, 20% PEG 3350, pH 8.4. However, no crytallization condition for rcrustinPm7 was found. ครัสทิน (crustin) จัดเป็นเปปไทด์ต้านจุลชีพ (Antimicrobial peptides, AMPs) ประเภทหนึ่งที่พบในระบบภูมิคุ้มกันแบบไม่จำเพาะของสัตว์จำพวกกุ้ง (crustacean) ก่อนหน้านี้มีการศึกษาความสามารถในการต่อต้านเชื้อแบคทีเรียของครัสทินพบว่า crustinPm1 มีฤทธิ์ในการต้านเชื้อแบคทีเรียชนิดแกรมบวกได้ดี ในขณะที่ crustinPm7 สามารถต้านเชื้อแบคทีเรียได้ทั้งแบคทีเรียชนิดแกรมบวกและแกรมลบ งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์คือ (1) ศึกษาสมบัติการจับของรีคอมบิแนนท์ crustinPm1 และ crustinPm7 กับเซลล์แบคทีเรียและองค์ประกอบของผนังเซลล์แบคทีเรีย lipoteichoic acid (LTA) และ lipopolysaccharide (LPS) (2) ศึกษาฤทธิ์ในการเหนี่ยวนำให้เกิด bacterial agglutination ของครัสทินทั้งสองชนิด (3) ศึกษาผลของครัสทินต่อการเปลี่ยนแปลง Inner membrane (IM) permeability (4) ศึกษาผลของครัสทินต่อการเปลี่ยนแปลงทางกายภาพของเซลล์แบคทีเรีย และ (5) ศึกษาสภาวะที่เหมาะสมในการตกผลึก crustinPm1 และ crustinPm7 ในงานวิจัยนี้ได้ผลิตรีคอมบิแนนท์โปรตีนครัสทินทั้งสองไอโซฟอร์มใน Escherichia coli ในสภาวะที่โปรตีนเสียสภาพ (denaturing condition) จากนั้นทำให้โปรตีนคืนสภาพ (renature) เพื่อใช้ทดสอบฤทธิ์ในการต้านเชื้อแบคทีเรีย จากการทดสอบคุณสมบัติการจับของครัสทินกับเซลล์แบคทีเรีย และองค์ประกอบของผนังเซลล์แบคทีเรีย พบว่าครัสทินทั้งสองไอโซฟอร์มสามารถจับกับแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบและจับกับองค์ประกอบของผนังเซลล์ lipoteichoic acid และ lipopolysaccharide ได้ นอกจากนี้ครัสทินยังสามารถเหนี่ยวนำให้เกิด bacterial agglutination ในแบคทีเรียบางสายพันธุ์ และทำให้เกิดการรั่วซึมของสารภายในไซโตพลาสซึมของ E. coli สายพันธุ์ MG1655 ออกสู่ภายนอกเซลล์ได้ เมื่อผสม crustinPm7 กับ Staphylococcus aureus, Escherichia coli และ Vibrio harveyi แล้วนำไปตรวจสอบด้วยเทคนิค Scanning Electron Microscopy (SEM) พบว่า เกิดการเปลี่ยนแปลงผนังเซลล์แบคทีเรียทุกสายพันธุ์ ในขณะที่ crustinPm1 สามารถทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงผนังเซลล์ของ S. aureus และ E. coli เท่านั้น จากการทดลองหาสภาวะที่เหมาะสมในการตกผลึกครัสทิน พบว่า crustinPm1 ตกผลึกในสารละลายที่มีองค์ประกอบของ 0.2 M Lithium citrate tribasic tetrahydrate, 20% PEG 3350 pH 8.4 อย่างไรก็ตาม ยังไม่พบสภาวะที่เหมาะสมในการตกผลึก crutinPm7 2013-10-24T11:33:17Z 2013-10-24T11:33:17Z 2010 Thesis http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/36358 10.14457/CU.the.2010.880 en http://doi.org/10.14457/CU.the.2010.880 Chulalongkorn University application/pdf Chulalongkorn University

Similar Items