คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์

Shrimp ovarian peritrophin (SOP), a major protein in jelly layer and cortical rods, plays a role in egg protection after spawning. Previous study, sequence of SOP gene from Fenneropenaeus merguiensis (Fm-SOP) was composed of domain A and domain B. The SOP domain A contains amino acid sequences betwe...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: วิไลวรรณ โชติเกียรติ, ปัญชลิกา เดชะมาก
Other Authors: The Center for Genomics and Bioinformatics Research
Format: Technical Report
Language:Thai
Published: มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ 2022
Subjects:
Online Access:http://kb.psu.ac.th/psukb/handle/2016/17382
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Institution: Prince of Songkhla University
Language: Thai
id th-psu.2016-17382
record_format dspace
spelling th-psu.2016-173822022-02-02T04:02:04Z คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์ Characterization of Shrimp Ovarian Peritrophin domain A for antimicrobial activity รายงานวิจัยฉบับสมบูรณ์ โครงการวิจัยเรื่อง คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์ วิไลวรรณ โชติเกียรติ ปัญชลิกา เดชะมาก The Center for Genomics and Bioinformatics Research สถานวิจัยจีโนมและชีวสารสนเทศ กุ้ง ชีววิทยา โปรตีน Shrimp ovarian peritrophin (SOP), a major protein in jelly layer and cortical rods, plays a role in egg protection after spawning. Previous study, sequence of SOP gene from Fenneropenaeus merguiensis (Fm-SOP) was composed of domain A and domain B. The SOP domain A contains amino acid sequences between 1-80 of Fm-SOP. The domain A had six conserved cysteines which may inhibit microorganism. The molecular weight of purified SOP-A protein was about 9 kDa. Antimicrobial activity of SOP-A protein was investigate by liquid growth inhibition assay. Minimal Inhibition Concentration (MIC) of SOP-A with Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Vibrio harveyi, Candida albicans and Fusarium oxysporum were 0.035 mg/ml, 0.28 mg/ml, 0.28 mg/ml, 0.57 mg/ml and 0.015 mg/ml, respectively. The SOP-A protein was able to agglutinate V. harveyi in vitro and displayed a chitinase activity. Moreover, the SOP-A protein also displayed proteinase inhibitory activity against trypsin. In addition the stability of SOP-A protein was tested and found decrease antimicrobial activity after incubation at 50 °C for 5 h. Shrimp (Ovarian Peritrophin เป็นโปรตีนที่พบใน jelly eyer และ cortical rod ทําหน้าที่ในการ ป้องกันไข่กุ้งจากสิ่งอันตรายภายนอกทันทีหลังจากที่กุ้งวางไข่ จากการศึกษาที่ผ่านมาพบว่าลําดับกรดอะมิ โนของยืน SOP ของกุ้งแชบ๊วย Fenneropenaeus merguiensis) ประกอบด้วย 2 domain คือ domain A และ domain B ซึ่งในส่วนของ domain A จะเริ่มตั้งแต่กรดอะมิโนตําแหน่งที่ 1-80 ของยีน Fm-SOP นั้น ประกอบด้วย cysteine-rich domains ซึ่งเป็นลักษณะหนึ่งที่พบใน antimicrobial peptide หลายชนิด การ ทดลองนี้ได้ทําการผลิตโปรตีนลูกผสม SOP-A พบว่าโปรตีนที่ผลิตได้มีขนาดประมาณ 9 KDa หลังจากนั้น นําโปรตีนนี้ไปทดสอบคุณสมบัติการด้านจุลชีพด้วยวิธี liquid growth inhibition assay พบว่าโปรตีน SOPA มีฤทธิ์ในการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อ Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Tibrio harveyi, Candida albicans และ Fusarium crysportan โดยมีค่าความเข้มข้นต่ําสุดที่สามารถยับยั้งเชื่อได้ (MIC) เท่ากับ 0.035 mg/ml, 0.28 mg ml, 0.28 mg/ml, 0.57 mg/ml และ 0.015 mg/ml ตามลําดับและเมื่อทดสอบ การออกฤทธิ์ของโปรตีนพบว่าโปรตีน SOP-A มีความสามารถในการทําให้ r. harvey เกิดการเกาะกลุ่ม (agglutinate) และมีคุณสมบัติเป็นเอนไซม์ไคติเนสนอกจากนี้ยังมีคุณสมบัติในการยับยั้งการทํางานของ เอนไซม์โปรตีนเนส โดยสามารถยับยั้งการทํางานของเอนไซม์ Trypsin และจากการศึกษาความคงตัวของ โปรตีน SOP-A พบว่าโปรตีน SOP-A มีประสิทธิภาพในการต้านเชื้อ S. aureus ลดลงเมื่อบ่มโปรตีนที่ อุณหภูมิ 50 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 5 ชั่วโมง 2022-01-21T07:43:07Z 2022-01-21T07:43:07Z 2558 Technical Report http://kb.psu.ac.th/psukb/handle/2016/17382 th application/pdf มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
institution Prince of Songkhla University
building Khunying Long Athakravi Sunthorn Learning Resources Center
continent Asia
country Thailand
Thailand
content_provider Khunying Long Athakravi Sunthorn Learning Resources Center
collection PSU Knowledge Bank
language Thai
topic กุ้ง
ชีววิทยา
โปรตีน
spellingShingle กุ้ง
ชีววิทยา
โปรตีน
วิไลวรรณ โชติเกียรติ
ปัญชลิกา เดชะมาก
คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
description Shrimp ovarian peritrophin (SOP), a major protein in jelly layer and cortical rods, plays a role in egg protection after spawning. Previous study, sequence of SOP gene from Fenneropenaeus merguiensis (Fm-SOP) was composed of domain A and domain B. The SOP domain A contains amino acid sequences between 1-80 of Fm-SOP. The domain A had six conserved cysteines which may inhibit microorganism. The molecular weight of purified SOP-A protein was about 9 kDa. Antimicrobial activity of SOP-A protein was investigate by liquid growth inhibition assay. Minimal Inhibition Concentration (MIC) of SOP-A with Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Vibrio harveyi, Candida albicans and Fusarium oxysporum were 0.035 mg/ml, 0.28 mg/ml, 0.28 mg/ml, 0.57 mg/ml and 0.015 mg/ml, respectively. The SOP-A protein was able to agglutinate V. harveyi in vitro and displayed a chitinase activity. Moreover, the SOP-A protein also displayed proteinase inhibitory activity against trypsin. In addition the stability of SOP-A protein was tested and found decrease antimicrobial activity after incubation at 50 °C for 5 h.
author2 The Center for Genomics and Bioinformatics Research
author_facet The Center for Genomics and Bioinformatics Research
วิไลวรรณ โชติเกียรติ
ปัญชลิกา เดชะมาก
format Technical Report
author วิไลวรรณ โชติเกียรติ
ปัญชลิกา เดชะมาก
author_sort วิไลวรรณ โชติเกียรติ
title คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
title_short คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
title_full คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
title_fullStr คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
title_full_unstemmed คุณสมบัติของโปรตีน Shrimp Ovarian Peritrophin domain A (SOP-A) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
title_sort คุณสมบัติของโปรตีน shrimp ovarian peritrophin domain a (sop-a) ในการยับยั้งจุลินทรีย์
publisher มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
publishDate 2022
url http://kb.psu.ac.th/psukb/handle/2016/17382
_version_ 1735499256652890112