PREDICTION OF INTERACTION USING MOLECULAR DOCKING AND MOLECULAR DYNAMICS OF NATURAL COMPOUNDS FROM SEVERAL PLANTS AS CATHEPSIN L INHIBITOR AND ITS TOXICITY PREDICTION TEST

• Main Author: Rizkia Fabelle, Nabilla
• Format: Final Project
• Language: Indonesia
• Online Access: https://digilib.itb.ac.id/gdl/view/46653
• Institution: Institut Teknologi Bandung

Paparan sinar UV secara terus menerus dapat menyebabkan terjadinya photoaging yang diawali dari inflamasi pada kulit. Keadaan tersebut dapat mengaktivasi cathepsin L yang dapat mendegradasi matriks ekstraselular dan kolagen pada kulit. Oleh karena itu, cathepsin L dijadikan salah satu target antiaging yang sampai saat ini masih terus dikembangkan. Tiga jenis tanaman khas Indonesia yaitu tahongai (Kleinhovia hospita), kemiri (Aleurites moluccana), dan pegagan (Centella asiatica) dipercaya secara turun menurun memiliki efek antiinflamasi. Tujuan penelitian ini yaitu untuk memprediksi aktivitas 31 senyawa yang terkandung dalam tahongai, kemiri, dan pegagan sebagai inhibitor cathepsin L dan tingkat toksisitasnya. Ketiga puluh satu senyawa ini, dioptimasi strukturnya dengan menggunakan Chimera 1.13.1rc and ChemBio 3D Ultra 12.0. Adapun studi interaksi seperti molecular docking dilakukan dengan menggunakan Autodock 4.2.6 dan untuk simulasi molecular dynamics digunakan Amber 18. Analisis interaksi molekul dilakukan dengan menggunakan Ligand Scout 4.2.1 dan Biovia Discovery Studio 2017. Pada uji toksisitas, program ADMET Predictor 7.1 digunakan. Berdasarkan hasil penambatan molekul dan dinamika molekul????ÿ?±ð?í?????????ð????ð?± !????????-Amyrin, dan castiliferol memberikan nilai energi ikat lebih rendah dari kontrol positif (-27.0925, -28.6813, dan -26.0037 kcal/mol) serta menunjukkan adanya interaksi ­±?ã•?????±????ð­????????±????±????????ð ??????????????????????????????????????????????????­•?????????????????????????•­• ­•±????•í ????????­ð ????ð????ð •ÿ????ð»?????• ????•?ã ¢±????­±ÿ•????•? dengan residu triad catalytic. Ketiga senyawa tersebut telah melalui uji toksistas yang meliputi uji sensitisasi, mutagenisitas, karsinogenisitas, serta toksisitas lingkungan. Berdasarkan serangkaian hasil uji, ­•????•????­ð????ð??????????ÿ•?¢•í????• ????±?????•????• ????-Amyrin merupakan kandidat terbaik karena energi ikat yang rendah serta aman.