EKSPLORASI ENZIM LIPASE DARI SEDIMEN SUNGAI DENGAN PENDEKATAN METAGENOMIK

• Main Author: BUDI PUTRI AYU ANDINA, 081142002
• Format: Theses and Dissertations NonPeerReviewed
• Language: Indonesian; Indonesian
• Published: 2013
• Subjects: QH301 Biology; QH426 Genetics; QH540-549.5 Ecology; QR1-502 Microbiology
• Online Access: http://repository.unair.ac.id/38511/2/gdlhub-gdl-s2-2014-andinabudi-29720-5.abstr-k.pdf; http://repository.unair.ac.id/38511/1/gdlhub-gdl-s2-2014-andinabudi-29720-full%20text.pdf; http://repository.unair.ac.id/38511/; http://lib.unair.ac.id
• Institution: Universitas Airlangga

Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi enzim lipase dari sedimen sungai melalui pendekatan metagenomik. Metagenomik adalah analisis genom komunitas mikroorganisme tanpa harus mengkulturkannya terlebih dahulu. Sampel sedimen sungai diambil dari kali Gedangan, Sidoarjo, Jawa Timur. DNA metagenom diekstraksi secara langsung dari sampel sedimen sungai dengan metode Zhou. Konstruksi pustaka metagenom dilakukan dengan cara kloning gen menggunakan vektor fosmid pCC2FOS dan sel inang E. coli EPI300-T1R. Skrining klon penghasil enzim lipase dilakukan didasarkan pada fungsi (aktivitas lipolitiknya), menggunakan media Luria-Bertani agar/rhodamin B yang ditambah substrat minyak zaitun 1%. Dari 32 klon rekombinan yang diperoleh, terdapat 5 klon positif penghasil enzim lipase, yaitu klon nomor 9, 20, 23, 24, dan 27. Uji aktivitas enzim lipase dilakukan menggunakan substrat p-nitrofenil palmitat pada suhu 37°C selama 5 menit untuk klon nomor 9 dan 20, dan 10 menit untuk klon nomor 23, 24, dan 27. Aktivitas enzim lipase paling tinggi ditunjukkan oleh klon nomor 27, yaitu sebesar 0,011 U/mL.