ANALISIS MOLEKULER GEN rpoB Mycobacterium tuberculosis PADA PASIEN MULTIDRUG RESISTANT TUBERKULOSIS (MDR-TB) DI RSUD dr. SOETOMO
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui susunan basa nukleotida gen rpoB Mycobacterium tuberculosis pasien multidrug resistant tuberkulosis (MDRTB) di RSUD dr. Soetomo, perbedaan urutan basa nukleotida dalam sampel, dan perbedaan urutan basa nukleotida sampel dengan sequence gen rpoB M. tuberc...
Saved in:
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Theses and Dissertations NonPeerReviewed |
| Language: | Indonesian Indonesian |
| Published: |
2018
|
| Subjects: | |
| Online Access: | http://repository.unair.ac.id/78187/1/KKC%20KK%20MPB.37-18%20Kus%20a%20ABSTRAK.pdf http://repository.unair.ac.id/78187/2/KKC%20KK%20MPB.37-18%20Kus%20a%20SKRIPSI.pdf http://repository.unair.ac.id/78187/ http://lib.unair.ac.id |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Institution: | Universitas Airlangga |
| Language: | Indonesian Indonesian |
| Summary: | Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui susunan basa nukleotida gen
rpoB Mycobacterium tuberculosis pasien multidrug resistant tuberkulosis (MDRTB)
di RSUD dr. Soetomo, perbedaan urutan basa nukleotida dalam sampel, dan
perbedaan urutan basa nukleotida sampel dengan sequence gen rpoB M.
tuberculosis H37Rv dari GenBank. Sampel yang digunakan adalah sputum pasien
terkonfirmasi MDR-TB oleh GeneXpert yang didapatkan dari RSUD dr. Soetomo
yang didekontaminasi menggunakan metode Modified Alkali Petroff dan
dilakukan isolasi DNA total dengan Bacteria DNA Preparation Kit. Gen rpoB
Mycobacterium tuberculosis diamplifikasi dari DNA total menggunakan primer
primer Pol B-5A dan Pol B-5B dan My Taq™ HS Red Mix. Produk hasil
amplifikasi dielektroforesis untuk memverifikasi keberadaan fragmen gen rpoB
M. tuberculosis sebesar 619 bp. Sequence hasil sequencing dianalisis
mengggunakan program Geneious R11 dan Basic Local Alignment Search Tool
(BLAST). Hasil sequence sampel post trimming gen rpoB M. tuberculosis
memiliki ukuran 502-524 bp yang terletak pada basa ke 1281-1804. Keempat
sampel sequence gen rpoB M. tuberculosis memiliki persentase kesamaan genetik
100% di dalam populasi sampel. Hasil konsensus multiple sequence alignment
menunjukkan bahwa sequence gen rpoB M. tuberculosis sampel tidak memiliki
urutan basa yang berbeda dengan sequence gen rpoB M. tuberculosis H37Rv,
complete genome (accession number AL 123456.3, CP007027.1, CP009480.1,
dan CP003248.2) yang merupakan strain wild type dan menjadi reference
sequence dalam penelitian ini. |
|---|