Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

10.1038/s41467-019-09799-2

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: Menden, M.P., Wang, D., Mason, M.J., Szalai, B., Bulusu, K.C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B.S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F.S., Al-lazikani, B., Alam, T., Allam, A., Allen, C., de Almeida, M.P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A.A., Ash, J.R., Aznar, V.R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P.J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K.A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K.-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M.D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D.V., Dang, C.C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F.-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H.B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A.O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A.B.K., Fotso, D.C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J.M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L.S., Hellton, K.H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M.R., Hidru, D., Hill, S.M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y.-C., Hu, Z., Huang, J.K., Huang, R.S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T.H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O.B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P.J., Kanev, G.K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A.M., Khan, S.A., Kiani, N.A., Kim, A., Kim, J., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kirk, P.D.W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A.J., Kuenemann, M.A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y.W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W.K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D.D., Malpartida, A.B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R.A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M.V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C.D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M.A., Ramnarine, R., Reid, J.E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J.R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J.A., Serra, J., Shang, M.-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I.F., Soerensen, P., Song, J.-H., Song, S.O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S.P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z.-U.-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S.A.M., Tran, H., Troyer, E.D., Truong, A.
Other Authors: DEPARTMENT OF COMPUTER SCIENCE
Format: Article
Published: 2021
Online Access:https://scholarbank.nus.edu.sg/handle/10635/210396
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Institution: National University of Singapore
id sg-nus-scholar.10635-210396
record_format dspace
institution National University of Singapore
building NUS Library
continent Asia
country Singapore
Singapore
content_provider NUS Library
collection ScholarBank@NUS
description 10.1038/s41467-019-09799-2
author2 DEPARTMENT OF COMPUTER SCIENCE
author_facet DEPARTMENT OF COMPUTER SCIENCE
Menden, M.P.
Wang, D.
Mason, M.J.
Szalai, B.
Bulusu, K.C.
Guan, Y.
Yu, T.
Kang, J.
Jeon, M.
Wolfinger, R.
Nguyen, T.
Zaslavskiy, M.
Abante, J.
Abecassis, B.S.
Aben, N.
Aghamirzaie, D.
Aittokallio, T.
Akhtari, F.S.
Al-lazikani, B.
Alam, T.
Allam, A.
Allen, C.
de Almeida, M.P.
Altarawy, D.
Alves, V.
Amadoz, A.
Anchang, B.
Antolin, A.A.
Ash, J.R.
Aznar, V.R.
Ba-alawi, W.
Bagheri, M.
Bajic, V.
Ball, G.
Ballester, P.J.
Baptista, D.
Bare, C.
Bateson, M.
Bender, A.
Bertrand, D.
Wijayawardena, B.
Boroevich, K.A.
Bosdriesz, E.
Bougouffa, S.
Bounova, G.
Brouwer, T.
Bryant, B.
Calaza, M.
Calderone, A.
Calza, S.
Capuzzi, S.
Carbonell-Caballero, J.
Carlin, D.
Carter, H.
Castagnoli, L.
Celebi, R.
Cesareni, G.
Chang, H.
Chen, G.
Chen, H.
Chen, H.
Cheng, L.
Chernomoretz, A.
Chicco, D.
Cho, K.-H.
Cho, S.
Choi, D.
Choi, J.
Choi, K.
Choi, M.
Cock, M.D.
Coker, E.
Cortes-Ciriano, I.
Cserzö, M.
Cubuk, C.
Curtis, C.
Daele, D.V.
Dang, C.C.
Dijkstra, T.
Dopazo, J.
Draghici, S.
Drosou, A.
Dumontier, M.
Ehrhart, F.
Eid, F.-E.
ElHefnawi, M.
Elmarakeby, H.
van Engelen, B.
Engin, H.B.
de Esch, I.
Evelo, C.
Falcao, A.O.
Farag, S.
Fernandez-Lozano, C.
Fisch, K.
Flobak, A.
Fornari, C.
Foroushani, A.B.K.
Fotso, D.C.
Fourches, D.
Friend, S.
Frigessi, A.
Gao, F.
Gao, X.
Gerold, J.M.
Gestraud, P.
Ghosh, S.
Gillberg, J.
Godoy-Lorite, A.
Godynyuk, L.
Godzik, A.
Goldenberg, A.
Gomez-Cabrero, D.
Gonen, M.
de Graaf, C.
Gray, H.
Grechkin, M.
Guimera, R.
Guney, E.
Haibe-Kains, B.
Han, Y.
Hase, T.
He, D.
He, L.
Heath, L.S.
Hellton, K.H.
Helmer-Citterich, M.
Hidalgo, M.R.
Hidru, D.
Hill, S.M.
Hochreiter, S.
Hong, S.
Hovig, E.
Hsueh, Y.-C.
Hu, Z.
Huang, J.K.
Huang, R.S.
Hunyady, L.
Hwang, J.
Hwang, T.H.
Hwang, W.
Hwang, Y.
Isayev, O.
Don’t Walk, O.B.
Jack, J.
Jahandideh, S.
Ji, J.
Jo, Y.
Kamola, P.J.
Kanev, G.K.
Karacosta, L.
Karimi, M.
Kaski, S.
Kazanov, M.
Khamis, A.M.
Khan, S.A.
Kiani, N.A.
Kim, A.
Kim, J.
Kim, J.
Kim, K.
Kim, K.
Kim, S.
Kim, Y.
Kim, Y.
Kirk, P.D.W.
Kitano, H.
Klambauer, G.
Knowles, D.
Ko, M.
Kohn-Luque, A.
Kooistra, A.J.
Kuenemann, M.A.
Kuiper, M.
Kurz, C.
Kwon, M.
van Laarhoven, T.
Laegreid, A.
Lederer, S.
Lee, H.
Lee, J.
Lee, Y.W.
Lepp_aho, E.
Lewis, R.
Li, J.
Li, L.
Liley, J.
Lim, W.K.
Lin, C.
Liu, Y.
Lopez, Y.
Low, J.
Lysenko, A.
Machado, D.
Madhukar, N.
Maeyer, D.D.
Malpartida, A.B.
Mamitsuka, H.
Marabita, F.
Marchal, K.
Marttinen, P.
Mason, D.
Mazaheri, A.
Mehmood, A.
Mehreen, A.
Michaut, M.
Miller, R.A.
Mitsopoulos, C.
Modos, D.
Moerbeke, M.V.
Moo, K.
Motsinger-Reif, A.
Movva, R.
Muraru, S.
Muratov, E.
Mushthofa, M.
Nagarajan, N.
Nakken, S.
Nath, A.
Neuvial, P.
Newton, R.
Ning, Z.
Niz, C.D.
Oliva, B.
Olsen, C.
Palmeri, A.
Panesar, B.
Papadopoulos, S.
Park, J.
Park, S.
Park, S.
Pawitan, Y.
Peluso, D.
Pendyala, S.
Peng, J.
Perfetto, L.
Pirro, S.
Plevritis, S.
Politi, R.
Poon, H.
Porta, E.
Prellner, I.
Preuer, K.
Pujana, M.A.
Ramnarine, R.
Reid, J.E.
Reyal, F.
Richardson, S.
Ricketts, C.
Rieswijk, L.
Rocha, M.
Rodriguez-Gonzalvez, C.
Roell, K.
Rotroff, D.
de Ruiter, J.R.
Rukawa, P.
Sadacca, B.
Safikhani, Z.
Safitri, F.
Sales-Pardo, M.
Sauer, S.
Schlichting, M.
Seoane, J.A.
Serra, J.
Shang, M.-M.
Sharma, A.
Sharma, H.
Shen, Y.
Shiga, M.
Shin, M.
Shkedy, Z.
Shopsowitz, K.
Sinai, S.
Skola, D.
Smirnov, P.
Soerensen, I.F.
Soerensen, P.
Song, J.-H.
Song, S.O.
Soufan, O.
Spitzmueller, A.
Steipe, B.
Suphavilai, C.
Tamayo, S.P.
Tamborero, D.
Tang, J.
Tanoli, Z.-U.-R.
Tarres-Deulofeu, M.
Tegner, J.
Thommesen, L.
Tonekaboni, S.A.M.
Tran, H.
Troyer, E.D.
Truong, A.
format Article
author Menden, M.P.
Wang, D.
Mason, M.J.
Szalai, B.
Bulusu, K.C.
Guan, Y.
Yu, T.
Kang, J.
Jeon, M.
Wolfinger, R.
Nguyen, T.
Zaslavskiy, M.
Abante, J.
Abecassis, B.S.
Aben, N.
Aghamirzaie, D.
Aittokallio, T.
Akhtari, F.S.
Al-lazikani, B.
Alam, T.
Allam, A.
Allen, C.
de Almeida, M.P.
Altarawy, D.
Alves, V.
Amadoz, A.
Anchang, B.
Antolin, A.A.
Ash, J.R.
Aznar, V.R.
Ba-alawi, W.
Bagheri, M.
Bajic, V.
Ball, G.
Ballester, P.J.
Baptista, D.
Bare, C.
Bateson, M.
Bender, A.
Bertrand, D.
Wijayawardena, B.
Boroevich, K.A.
Bosdriesz, E.
Bougouffa, S.
Bounova, G.
Brouwer, T.
Bryant, B.
Calaza, M.
Calderone, A.
Calza, S.
Capuzzi, S.
Carbonell-Caballero, J.
Carlin, D.
Carter, H.
Castagnoli, L.
Celebi, R.
Cesareni, G.
Chang, H.
Chen, G.
Chen, H.
Chen, H.
Cheng, L.
Chernomoretz, A.
Chicco, D.
Cho, K.-H.
Cho, S.
Choi, D.
Choi, J.
Choi, K.
Choi, M.
Cock, M.D.
Coker, E.
Cortes-Ciriano, I.
Cserzö, M.
Cubuk, C.
Curtis, C.
Daele, D.V.
Dang, C.C.
Dijkstra, T.
Dopazo, J.
Draghici, S.
Drosou, A.
Dumontier, M.
Ehrhart, F.
Eid, F.-E.
ElHefnawi, M.
Elmarakeby, H.
van Engelen, B.
Engin, H.B.
de Esch, I.
Evelo, C.
Falcao, A.O.
Farag, S.
Fernandez-Lozano, C.
Fisch, K.
Flobak, A.
Fornari, C.
Foroushani, A.B.K.
Fotso, D.C.
Fourches, D.
Friend, S.
Frigessi, A.
Gao, F.
Gao, X.
Gerold, J.M.
Gestraud, P.
Ghosh, S.
Gillberg, J.
Godoy-Lorite, A.
Godynyuk, L.
Godzik, A.
Goldenberg, A.
Gomez-Cabrero, D.
Gonen, M.
de Graaf, C.
Gray, H.
Grechkin, M.
Guimera, R.
Guney, E.
Haibe-Kains, B.
Han, Y.
Hase, T.
He, D.
He, L.
Heath, L.S.
Hellton, K.H.
Helmer-Citterich, M.
Hidalgo, M.R.
Hidru, D.
Hill, S.M.
Hochreiter, S.
Hong, S.
Hovig, E.
Hsueh, Y.-C.
Hu, Z.
Huang, J.K.
Huang, R.S.
Hunyady, L.
Hwang, J.
Hwang, T.H.
Hwang, W.
Hwang, Y.
Isayev, O.
Don’t Walk, O.B.
Jack, J.
Jahandideh, S.
Ji, J.
Jo, Y.
Kamola, P.J.
Kanev, G.K.
Karacosta, L.
Karimi, M.
Kaski, S.
Kazanov, M.
Khamis, A.M.
Khan, S.A.
Kiani, N.A.
Kim, A.
Kim, J.
Kim, J.
Kim, K.
Kim, K.
Kim, S.
Kim, Y.
Kim, Y.
Kirk, P.D.W.
Kitano, H.
Klambauer, G.
Knowles, D.
Ko, M.
Kohn-Luque, A.
Kooistra, A.J.
Kuenemann, M.A.
Kuiper, M.
Kurz, C.
Kwon, M.
van Laarhoven, T.
Laegreid, A.
Lederer, S.
Lee, H.
Lee, J.
Lee, Y.W.
Lepp_aho, E.
Lewis, R.
Li, J.
Li, L.
Liley, J.
Lim, W.K.
Lin, C.
Liu, Y.
Lopez, Y.
Low, J.
Lysenko, A.
Machado, D.
Madhukar, N.
Maeyer, D.D.
Malpartida, A.B.
Mamitsuka, H.
Marabita, F.
Marchal, K.
Marttinen, P.
Mason, D.
Mazaheri, A.
Mehmood, A.
Mehreen, A.
Michaut, M.
Miller, R.A.
Mitsopoulos, C.
Modos, D.
Moerbeke, M.V.
Moo, K.
Motsinger-Reif, A.
Movva, R.
Muraru, S.
Muratov, E.
Mushthofa, M.
Nagarajan, N.
Nakken, S.
Nath, A.
Neuvial, P.
Newton, R.
Ning, Z.
Niz, C.D.
Oliva, B.
Olsen, C.
Palmeri, A.
Panesar, B.
Papadopoulos, S.
Park, J.
Park, S.
Park, S.
Pawitan, Y.
Peluso, D.
Pendyala, S.
Peng, J.
Perfetto, L.
Pirro, S.
Plevritis, S.
Politi, R.
Poon, H.
Porta, E.
Prellner, I.
Preuer, K.
Pujana, M.A.
Ramnarine, R.
Reid, J.E.
Reyal, F.
Richardson, S.
Ricketts, C.
Rieswijk, L.
Rocha, M.
Rodriguez-Gonzalvez, C.
Roell, K.
Rotroff, D.
de Ruiter, J.R.
Rukawa, P.
Sadacca, B.
Safikhani, Z.
Safitri, F.
Sales-Pardo, M.
Sauer, S.
Schlichting, M.
Seoane, J.A.
Serra, J.
Shang, M.-M.
Sharma, A.
Sharma, H.
Shen, Y.
Shiga, M.
Shin, M.
Shkedy, Z.
Shopsowitz, K.
Sinai, S.
Skola, D.
Smirnov, P.
Soerensen, I.F.
Soerensen, P.
Song, J.-H.
Song, S.O.
Soufan, O.
Spitzmueller, A.
Steipe, B.
Suphavilai, C.
Tamayo, S.P.
Tamborero, D.
Tang, J.
Tanoli, Z.-U.-R.
Tarres-Deulofeu, M.
Tegner, J.
Thommesen, L.
Tonekaboni, S.A.M.
Tran, H.
Troyer, E.D.
Truong, A.
spellingShingle Menden, M.P.
Wang, D.
Mason, M.J.
Szalai, B.
Bulusu, K.C.
Guan, Y.
Yu, T.
Kang, J.
Jeon, M.
Wolfinger, R.
Nguyen, T.
Zaslavskiy, M.
Abante, J.
Abecassis, B.S.
Aben, N.
Aghamirzaie, D.
Aittokallio, T.
Akhtari, F.S.
Al-lazikani, B.
Alam, T.
Allam, A.
Allen, C.
de Almeida, M.P.
Altarawy, D.
Alves, V.
Amadoz, A.
Anchang, B.
Antolin, A.A.
Ash, J.R.
Aznar, V.R.
Ba-alawi, W.
Bagheri, M.
Bajic, V.
Ball, G.
Ballester, P.J.
Baptista, D.
Bare, C.
Bateson, M.
Bender, A.
Bertrand, D.
Wijayawardena, B.
Boroevich, K.A.
Bosdriesz, E.
Bougouffa, S.
Bounova, G.
Brouwer, T.
Bryant, B.
Calaza, M.
Calderone, A.
Calza, S.
Capuzzi, S.
Carbonell-Caballero, J.
Carlin, D.
Carter, H.
Castagnoli, L.
Celebi, R.
Cesareni, G.
Chang, H.
Chen, G.
Chen, H.
Chen, H.
Cheng, L.
Chernomoretz, A.
Chicco, D.
Cho, K.-H.
Cho, S.
Choi, D.
Choi, J.
Choi, K.
Choi, M.
Cock, M.D.
Coker, E.
Cortes-Ciriano, I.
Cserzö, M.
Cubuk, C.
Curtis, C.
Daele, D.V.
Dang, C.C.
Dijkstra, T.
Dopazo, J.
Draghici, S.
Drosou, A.
Dumontier, M.
Ehrhart, F.
Eid, F.-E.
ElHefnawi, M.
Elmarakeby, H.
van Engelen, B.
Engin, H.B.
de Esch, I.
Evelo, C.
Falcao, A.O.
Farag, S.
Fernandez-Lozano, C.
Fisch, K.
Flobak, A.
Fornari, C.
Foroushani, A.B.K.
Fotso, D.C.
Fourches, D.
Friend, S.
Frigessi, A.
Gao, F.
Gao, X.
Gerold, J.M.
Gestraud, P.
Ghosh, S.
Gillberg, J.
Godoy-Lorite, A.
Godynyuk, L.
Godzik, A.
Goldenberg, A.
Gomez-Cabrero, D.
Gonen, M.
de Graaf, C.
Gray, H.
Grechkin, M.
Guimera, R.
Guney, E.
Haibe-Kains, B.
Han, Y.
Hase, T.
He, D.
He, L.
Heath, L.S.
Hellton, K.H.
Helmer-Citterich, M.
Hidalgo, M.R.
Hidru, D.
Hill, S.M.
Hochreiter, S.
Hong, S.
Hovig, E.
Hsueh, Y.-C.
Hu, Z.
Huang, J.K.
Huang, R.S.
Hunyady, L.
Hwang, J.
Hwang, T.H.
Hwang, W.
Hwang, Y.
Isayev, O.
Don’t Walk, O.B.
Jack, J.
Jahandideh, S.
Ji, J.
Jo, Y.
Kamola, P.J.
Kanev, G.K.
Karacosta, L.
Karimi, M.
Kaski, S.
Kazanov, M.
Khamis, A.M.
Khan, S.A.
Kiani, N.A.
Kim, A.
Kim, J.
Kim, J.
Kim, K.
Kim, K.
Kim, S.
Kim, Y.
Kim, Y.
Kirk, P.D.W.
Kitano, H.
Klambauer, G.
Knowles, D.
Ko, M.
Kohn-Luque, A.
Kooistra, A.J.
Kuenemann, M.A.
Kuiper, M.
Kurz, C.
Kwon, M.
van Laarhoven, T.
Laegreid, A.
Lederer, S.
Lee, H.
Lee, J.
Lee, Y.W.
Lepp_aho, E.
Lewis, R.
Li, J.
Li, L.
Liley, J.
Lim, W.K.
Lin, C.
Liu, Y.
Lopez, Y.
Low, J.
Lysenko, A.
Machado, D.
Madhukar, N.
Maeyer, D.D.
Malpartida, A.B.
Mamitsuka, H.
Marabita, F.
Marchal, K.
Marttinen, P.
Mason, D.
Mazaheri, A.
Mehmood, A.
Mehreen, A.
Michaut, M.
Miller, R.A.
Mitsopoulos, C.
Modos, D.
Moerbeke, M.V.
Moo, K.
Motsinger-Reif, A.
Movva, R.
Muraru, S.
Muratov, E.
Mushthofa, M.
Nagarajan, N.
Nakken, S.
Nath, A.
Neuvial, P.
Newton, R.
Ning, Z.
Niz, C.D.
Oliva, B.
Olsen, C.
Palmeri, A.
Panesar, B.
Papadopoulos, S.
Park, J.
Park, S.
Park, S.
Pawitan, Y.
Peluso, D.
Pendyala, S.
Peng, J.
Perfetto, L.
Pirro, S.
Plevritis, S.
Politi, R.
Poon, H.
Porta, E.
Prellner, I.
Preuer, K.
Pujana, M.A.
Ramnarine, R.
Reid, J.E.
Reyal, F.
Richardson, S.
Ricketts, C.
Rieswijk, L.
Rocha, M.
Rodriguez-Gonzalvez, C.
Roell, K.
Rotroff, D.
de Ruiter, J.R.
Rukawa, P.
Sadacca, B.
Safikhani, Z.
Safitri, F.
Sales-Pardo, M.
Sauer, S.
Schlichting, M.
Seoane, J.A.
Serra, J.
Shang, M.-M.
Sharma, A.
Sharma, H.
Shen, Y.
Shiga, M.
Shin, M.
Shkedy, Z.
Shopsowitz, K.
Sinai, S.
Skola, D.
Smirnov, P.
Soerensen, I.F.
Soerensen, P.
Song, J.-H.
Song, S.O.
Soufan, O.
Spitzmueller, A.
Steipe, B.
Suphavilai, C.
Tamayo, S.P.
Tamborero, D.
Tang, J.
Tanoli, Z.-U.-R.
Tarres-Deulofeu, M.
Tegner, J.
Thommesen, L.
Tonekaboni, S.A.M.
Tran, H.
Troyer, E.D.
Truong, A.
Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
author_sort Menden, M.P.
title Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
title_short Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
title_full Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
title_fullStr Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
title_full_unstemmed Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
title_sort community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
publishDate 2021
url https://scholarbank.nus.edu.sg/handle/10635/210396
_version_ 1821184350516936704
spelling sg-nus-scholar.10635-2103962024-10-26T01:09:22Z Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen Menden, M.P. Wang, D. Mason, M.J. Szalai, B. Bulusu, K.C. Guan, Y. Yu, T. Kang, J. Jeon, M. Wolfinger, R. Nguyen, T. Zaslavskiy, M. Abante, J. Abecassis, B.S. Aben, N. Aghamirzaie, D. Aittokallio, T. Akhtari, F.S. Al-lazikani, B. Alam, T. Allam, A. Allen, C. de Almeida, M.P. Altarawy, D. Alves, V. Amadoz, A. Anchang, B. Antolin, A.A. Ash, J.R. Aznar, V.R. Ba-alawi, W. Bagheri, M. Bajic, V. Ball, G. Ballester, P.J. Baptista, D. Bare, C. Bateson, M. Bender, A. Bertrand, D. Wijayawardena, B. Boroevich, K.A. Bosdriesz, E. Bougouffa, S. Bounova, G. Brouwer, T. Bryant, B. Calaza, M. Calderone, A. Calza, S. Capuzzi, S. Carbonell-Caballero, J. Carlin, D. Carter, H. Castagnoli, L. Celebi, R. Cesareni, G. Chang, H. Chen, G. Chen, H. Chen, H. Cheng, L. Chernomoretz, A. Chicco, D. Cho, K.-H. Cho, S. Choi, D. Choi, J. Choi, K. Choi, M. Cock, M.D. Coker, E. Cortes-Ciriano, I. Cserzö, M. Cubuk, C. Curtis, C. Daele, D.V. Dang, C.C. Dijkstra, T. Dopazo, J. Draghici, S. Drosou, A. Dumontier, M. Ehrhart, F. Eid, F.-E. ElHefnawi, M. Elmarakeby, H. van Engelen, B. Engin, H.B. de Esch, I. Evelo, C. Falcao, A.O. Farag, S. Fernandez-Lozano, C. Fisch, K. Flobak, A. Fornari, C. Foroushani, A.B.K. Fotso, D.C. Fourches, D. Friend, S. Frigessi, A. Gao, F. Gao, X. Gerold, J.M. Gestraud, P. Ghosh, S. Gillberg, J. Godoy-Lorite, A. Godynyuk, L. Godzik, A. Goldenberg, A. Gomez-Cabrero, D. Gonen, M. de Graaf, C. Gray, H. Grechkin, M. Guimera, R. Guney, E. Haibe-Kains, B. Han, Y. Hase, T. He, D. He, L. Heath, L.S. Hellton, K.H. Helmer-Citterich, M. Hidalgo, M.R. Hidru, D. Hill, S.M. Hochreiter, S. Hong, S. Hovig, E. Hsueh, Y.-C. Hu, Z. Huang, J.K. Huang, R.S. Hunyady, L. Hwang, J. Hwang, T.H. Hwang, W. Hwang, Y. Isayev, O. Don’t Walk, O.B. Jack, J. Jahandideh, S. Ji, J. Jo, Y. Kamola, P.J. Kanev, G.K. Karacosta, L. Karimi, M. Kaski, S. Kazanov, M. Khamis, A.M. Khan, S.A. Kiani, N.A. Kim, A. Kim, J. Kim, J. Kim, K. Kim, K. Kim, S. Kim, Y. Kim, Y. Kirk, P.D.W. Kitano, H. Klambauer, G. Knowles, D. Ko, M. Kohn-Luque, A. Kooistra, A.J. Kuenemann, M.A. Kuiper, M. Kurz, C. Kwon, M. van Laarhoven, T. Laegreid, A. Lederer, S. Lee, H. Lee, J. Lee, Y.W. Lepp_aho, E. Lewis, R. Li, J. Li, L. Liley, J. Lim, W.K. Lin, C. Liu, Y. Lopez, Y. Low, J. Lysenko, A. Machado, D. Madhukar, N. Maeyer, D.D. Malpartida, A.B. Mamitsuka, H. Marabita, F. Marchal, K. Marttinen, P. Mason, D. Mazaheri, A. Mehmood, A. Mehreen, A. Michaut, M. Miller, R.A. Mitsopoulos, C. Modos, D. Moerbeke, M.V. Moo, K. Motsinger-Reif, A. Movva, R. Muraru, S. Muratov, E. Mushthofa, M. Nagarajan, N. Nakken, S. Nath, A. Neuvial, P. Newton, R. Ning, Z. Niz, C.D. Oliva, B. Olsen, C. Palmeri, A. Panesar, B. Papadopoulos, S. Park, J. Park, S. Park, S. Pawitan, Y. Peluso, D. Pendyala, S. Peng, J. Perfetto, L. Pirro, S. Plevritis, S. Politi, R. Poon, H. Porta, E. Prellner, I. Preuer, K. Pujana, M.A. Ramnarine, R. Reid, J.E. Reyal, F. Richardson, S. Ricketts, C. Rieswijk, L. Rocha, M. Rodriguez-Gonzalvez, C. Roell, K. Rotroff, D. de Ruiter, J.R. Rukawa, P. Sadacca, B. Safikhani, Z. Safitri, F. Sales-Pardo, M. Sauer, S. Schlichting, M. Seoane, J.A. Serra, J. Shang, M.-M. Sharma, A. Sharma, H. Shen, Y. Shiga, M. Shin, M. Shkedy, Z. Shopsowitz, K. Sinai, S. Skola, D. Smirnov, P. Soerensen, I.F. Soerensen, P. Song, J.-H. Song, S.O. Soufan, O. Spitzmueller, A. Steipe, B. Suphavilai, C. Tamayo, S.P. Tamborero, D. Tang, J. Tanoli, Z.-U.-R. Tarres-Deulofeu, M. Tegner, J. Thommesen, L. Tonekaboni, S.A.M. Tran, H. Troyer, E.D. Truong, A. DEPARTMENT OF COMPUTER SCIENCE 10.1038/s41467-019-09799-2 Nature Communications 10 1 2674 2021-12-14T04:49:51Z 2021-12-14T04:49:51Z 2019 Article Menden, M.P., Wang, D., Mason, M.J., Szalai, B., Bulusu, K.C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B.S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F.S., Al-lazikani, B., Alam, T., Allam, A., Allen, C., de Almeida, M.P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A.A., Ash, J.R., Aznar, V.R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P.J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K.A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K.-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M.D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D.V., Dang, C.C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F.-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H.B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A.O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A.B.K., Fotso, D.C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J.M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L.S., Hellton, K.H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M.R., Hidru, D., Hill, S.M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y.-C., Hu, Z., Huang, J.K., Huang, R.S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T.H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O.B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P.J., Kanev, G.K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A.M., Khan, S.A., Kiani, N.A., Kim, A., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kim, Y., Kirk, P.D.W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A.J., Kuenemann, M.A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y.W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W.K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D.D., Malpartida, A.B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R.A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M.V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C.D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M.A., Ramnarine, R., Reid, J.E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J.R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J.A., Serra, J., Shang, M.-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I.F., Soerensen, P., Song, J.-H., Song, S.O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S.P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z.-U.-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S.A.M., Tran, H., Troyer, E.D., Truong, A. (2019). Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen. Nature Communications 10 (1) : 2674. ScholarBank@NUS Repository. https://doi.org/10.1038/s41467-019-09799-2 https://scholarbank.nus.edu.sg/handle/10635/210396 Attribution 4.0 International https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Scopus OA2019