อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR
เชียงใหม่สัตวแพทยสาร เป็นวารสารเผยแพร่เผยแพร่ผลงานทางวิชาการที่มีคุณภาพในลักษณะต่าง ๆ เช่น บทความต้นฉบับ (Original article) บทความปริทัศน์ (Review article) รายงานฉบับย่อ (Short communication) และรายงานสัตว์ป่วย (Case report) ที่เกี่ยวข้องกับทางด้านสัตวแพทยศาสตร์ (Veterinary Science) และวิทยาศาสตร์เท...
Saved in:
| Main Authors: | , , , , , , , |
|---|---|
| Language: | Tha |
| Published: |
คณะสัตวแพทศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
2020
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://he02.tci-thaijo.org/index.php/vis/article/view/146664/108113 http://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/68712 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Institution: | Chiang Mai University |
| Language: | Tha |
| id |
th-cmuir.6653943832-68712 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
th-cmuir.6653943832-687122020-06-10T07:12:26Z อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR Discriminatory power and genotypic characterization of salmonella by PFGE and rep-PCR ผกามาศ ศุขรุ่งเรือง รวีวรรณ รุ่งฤดีสมบัติกิจ นิภา โชคสัจจะวาที ศริญญา พรเอี่ยม พชรพร บุญโคตร ภาคภูมิ ตาดี ประภาส พัชนี ภาณุวัฒน์ แย้มสกุล PFGE rep-PCR Salmonella spp. เชียงใหม่สัตวแพทยสาร เป็นวารสารเผยแพร่เผยแพร่ผลงานทางวิชาการที่มีคุณภาพในลักษณะต่าง ๆ เช่น บทความต้นฉบับ (Original article) บทความปริทัศน์ (Review article) รายงานฉบับย่อ (Short communication) และรายงานสัตว์ป่วย (Case report) ที่เกี่ยวข้องกับทางด้านสัตวแพทยศาสตร์ (Veterinary Science) และวิทยาศาสตร์เทคโนโลยีการสัตว์ (Animal Science and Technology) ได้แก่ ชีววิทยา สรีรวิทยา จุลชีววิทยา พยาธิวิทยา โภชนาการศาสตร์ กายวิภาคศาสตร์ พันธุศาสตร์ อายุรศาสตร์ ศัลยศาสตร์ สูติศาสตร์ วิทยาศาสตร์ทางชีวภาพวิทยาศาสตร์พื้นฐาน ระบาดวิทยาและแนวทางสุขภาพหนึ่งเดียว การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบอำนาจการจำแนกและความแตกต่างของลายพิมพ์ดีเอ็นเอของเชื้อ SalmonellaRissen และ SalmonellaTyphimurium โดยวิธีทางอณูชีววิทยา 2 วิธีได้แก่ Pulsed-field Gel Electrophoresis (PFGE) และ Repetitive Element sequence-based PCR (rep-PCR) ซึ่งเชื้อที่นำมาใช้ในการศึกษาครั้งนี้เป็นเชื้อ Salmonella ที่เพาะแยกจากฟาร์มสุกรในพื้นที่จังหวัดเชียงใหม่ ลำพูนได้ แก่เชื้อ SalmonellaRissen จำนวน 16 สายพันธุ์ และ SalmonellaTyphimurium จำนวน 14 สายพันธุ์ โดยยืนยันซีโรไทป์ของเชื้อแบคทีเรียโดยศูนย์ซัลโมเนลลาและชิเจลลา กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข ทำการจำแนกรูปแบบทางพันธุกรรมของเชื้อ ด้วยวิธี PFGE และ rep-PCR และรูปแบบลายพิมพ์ DNA ของเชื้อที่ได้จะเข้าสู่ขั้นตอนการเปรียบเทียบลักษณะความเหมือนและความแตกต่างและการสร้างแผนภูมิต้นไม้ โดยใช้ซอฟท์แวร์โปรแกรม Bionumerics version3.5 พบว่าวิธี PFGE มีอําานาจในการจําาแนก (Discriminatory power) เท่ากับ 0.43, 0.47, 0.85 และ 0.9 ที่ดัชนีความเหมือน (Similarity index) 80%, 85%, 90% และ 95% ตามลำดับ และวิธี rep-PCR มีอำนาจในการจำแนกเท่ากับ 0.55, 0.69, 0.88 และ 0.95 ที่ดัชนีความเหมือน (Similarity index) 80%, 85%, 90% และ 95% ตามลำดับ เชียงใหม่สัตวแพทยสาร 2557;12(1): 19-29 AbstractThis study wasaimed tocomparea discriminatory powerand to differentiateSalmonella Rissen and Salmonella Typhimurium DNA fingerprint by 2 molecular genotyping methods: Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) and Repetitive Element Sequence-based PCR (rep-PCR). Salmonellaisolates from pig farms in Chiang Mai and Lampoon province, including 14 Salmonella Rissen and 16 Salmonella Typhimurium isolates samples were included in the study. Salmonella serotypes were previously confirmed by National Salmonellae and Shigellae Center, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Thailand. All samples were then characterized genotypically by PFGE and rep-PCR. Salmonella DNA fingerprint was analyzed, and dendrogram was generated by Bionumerics software program version 3.5. The results of discriminatory power from PFGE were 0.43, 0.47, 0.85 and 0.9 at similarity index 80%, 85%, 90% and 95% respectively and discriminatory power from rep-PCR were0.55,0.69,0.88and 0.95at similarity index80%,85%,90% and 95% respectively. 2020-06-10T07:12:26Z 2020-06-10T07:12:26Z 2557 เชียงใหม่สัตวแพทยสาร 12,1 (ม.ค.-เม.ย. 2557) 19-29 0857-6920 https://he02.tci-thaijo.org/index.php/vis/article/view/146664/108113 http://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/68712 Tha คณะสัตวแพทศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ |
| institution |
Chiang Mai University |
| building |
Chiang Mai University Library |
| continent |
Asia |
| country |
Thailand Thailand |
| content_provider |
Chiang Mai University Library |
| collection |
CMU Intellectual Repository |
| language |
Tha |
| topic |
PFGE rep-PCR Salmonella spp. |
| spellingShingle |
PFGE rep-PCR Salmonella spp. ผกามาศ ศุขรุ่งเรือง รวีวรรณ รุ่งฤดีสมบัติกิจ นิภา โชคสัจจะวาที ศริญญา พรเอี่ยม พชรพร บุญโคตร ภาคภูมิ ตาดี ประภาส พัชนี ภาณุวัฒน์ แย้มสกุล อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR |
| description |
เชียงใหม่สัตวแพทยสาร เป็นวารสารเผยแพร่เผยแพร่ผลงานทางวิชาการที่มีคุณภาพในลักษณะต่าง ๆ เช่น บทความต้นฉบับ (Original article) บทความปริทัศน์ (Review article) รายงานฉบับย่อ (Short communication) และรายงานสัตว์ป่วย (Case report) ที่เกี่ยวข้องกับทางด้านสัตวแพทยศาสตร์ (Veterinary Science) และวิทยาศาสตร์เทคโนโลยีการสัตว์ (Animal Science and Technology) ได้แก่ ชีววิทยา สรีรวิทยา จุลชีววิทยา พยาธิวิทยา โภชนาการศาสตร์ กายวิภาคศาสตร์ พันธุศาสตร์ อายุรศาสตร์ ศัลยศาสตร์ สูติศาสตร์ วิทยาศาสตร์ทางชีวภาพวิทยาศาสตร์พื้นฐาน ระบาดวิทยาและแนวทางสุขภาพหนึ่งเดียว |
| author |
ผกามาศ ศุขรุ่งเรือง รวีวรรณ รุ่งฤดีสมบัติกิจ นิภา โชคสัจจะวาที ศริญญา พรเอี่ยม พชรพร บุญโคตร ภาคภูมิ ตาดี ประภาส พัชนี ภาณุวัฒน์ แย้มสกุล |
| author_facet |
ผกามาศ ศุขรุ่งเรือง รวีวรรณ รุ่งฤดีสมบัติกิจ นิภา โชคสัจจะวาที ศริญญา พรเอี่ยม พชรพร บุญโคตร ภาคภูมิ ตาดี ประภาส พัชนี ภาณุวัฒน์ แย้มสกุล |
| author_sort |
ผกามาศ ศุขรุ่งเรือง |
| title |
อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR |
| title_short |
อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR |
| title_full |
อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR |
| title_fullStr |
อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR |
| title_full_unstemmed |
อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ Salmonella โดยวิธี PFGE และ rep-PCR |
| title_sort |
อำนาจจำแนกและการศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ salmonella โดยวิธี pfge และ rep-pcr |
| publisher |
คณะสัตวแพทศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ |
| publishDate |
2020 |
| url |
https://he02.tci-thaijo.org/index.php/vis/article/view/146664/108113 http://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/68712 |
| _version_ |
1681752681837756416 |