Circulating microRNAs in sera correlate with soluble biomarkers of immune activation but do not predict mortality in ART treated individuals with HIV-1 infection: A case control study

• Main Authors: Murray D.D., Suzuki K., Law M., Trebicka J., Neuhaus J., Wentworth D., Johnson M., Vjecha M.J., Kelleher A.D., Emery S., Aagaard B., Aragon E., Arnaiz J., Borup L., Clotet B., Dragsted U., Fau A., Gey D., Grarup J., Hengge U., Herrero P., Jansson P., Jensen B., Jensen K., Juncher H., Lopez P., Lundgren J., Matthews C., Mollerup D., Pearson M., Phillips A., Reilev S., Tillmann K., Varea S., Angus B., Babiker A., Cordwell B., Darbyshire J., Dodds W., Fleck S., Horton J., Hudson F., Moraes Y., Pacciarini F., Palfreeman A., Paton N., Smith N., Van Hooff F., Bebchuk J., Collins G., Denning E., DuChene A., Fosdick L., Harrison M., Herman-Lamin K., Krum E., Larson G., Neaton J., Nelson R., Quan K., Quan S., Schultz T., Thompson G., Wyman N., Carey C., Chan F., Cooper D., Courtney-Rodgers D., Drummond F., Harrod M., Jacoby S., Kearney L., Lin E., Pett S., Robson R., Seneviratne N., Stewart M., Watts E., Finley E., Gordin F., Sánchez A., Standridge B., Belloso W., Davey R., Duprez D., Gatell J., Hoy J., Lifson A., Pederson C., Perez G., Price R., Prineas R., Rhame F., Sampson J., Worley J., Modlin J., Beral V., Chaisson R., Fleming T., Hill C., Kim K., Murray B., Pick B., Seligmann M., Weller I., Cahill K., Fox L., Luzar M., Martinez A., McNay L., Pierson J., Tierney J., Vogel S., Costas V., Eckstrand J., Brown S., Abusamra L., Angel E., Aquilia S., Benetucci J., Bittar V., Bogdanowicz E., Cahn P., Casiro A., Contarelli J., Corral J., Daciuk L., David D., Dobrzanski W., Duran A., Ebenrstejin J., Ferrari I., Fridman D., Galache V., Guaragna G., Ivalo S., Krolewiecki A., Lanusse I., Laplume H., Lasala M., Lattes R., Lazovski J., Lopardo G., Losso M., Lourtau L., Lupo S., Maranzana A., Marson C., Massera L., Moscatello G., Olivia S., Otegui I., Palacios L., Parlante A., Salomon H., Sanchez M., Somenzini C., Suarez C., Tocci M., Toibaro J., Zala C., Agrawal S., Ambrose P., Anderson C., Anderson J., Baker D., Beileiter K., Blavius K., Bloch M., Boyle M., Bradford D., Britton P., Brown P., Busic T., Cain A., Carrall L., Carson S., Chenoweth I., Chuah J., Clark F., Clemons J., Clezy K., Cortissos P., Cunningham N., Curry M., Daly L., D'Arcy-Evans C., Del Rosario R., Dinning S., Dobson P., Donohue W., Doong N., Downs C., Edwards E., Edwards S., Egan C., Ferguson W., Finlayson R., Forsdyke C., Foy L., Franic T., Frater A., French M., Gleeson D., Gold J., Habel P., Haig K., Hardy S., Holland R., Hudson J., Hutchison R., Hyland N., James R., Johnston C., Kelly M., King M., Kunkel K., Lau H., Leamy J., Lester D., Leung J., Lohmeyer A., Lowe K., MacRae K., Magness C., Martinez O., Maruszak H., Medland N., Miller S., Murray J., Negus P., Newman R., Ngieng M., Nowlan C., Oddy J., Orford N., Orth D., Patching J., Plummer M., Price S., Primrose R., Prone I., Ree H., Remington C., Richardson R., Robinson S., Rogers G., Roney J., Roth N., Russell D., Ryan S., Sarangapany J., Schmidt T., Schneider K., Shields C., Silberberg C., Shaw D., Skett J., Smith D., Soo T.M., Sowden D., Street A., Tee B.K., Thomson J., Topaz S., Vale R., Villella C., Walker A., Watson A., Wendt N., Williams L., Youds D., Aichelburg A., Cichon P., Gemeinhart B., Rieger A., Schmied B., Touzeau-Romer V., Vetter N., Colebunders R., Clumeck N., DeRoo A., Kabeya K., O'Doherty E., De Wit S., De Salles Amorim C., Basso C., Flint S., Kallas E., Levi G., Lewi D., Pereira L., Jr., Da Silva M., Souza T., Toscano A., Angel J., Arsenault M., Bast M., Beckthold B., Bouchard P., Chabot I., Clarke R., Cohen J., Coté P., Ellis M., Gagne C., Gill J., Houde M., Johnston B., Jubinville N., Kato C., Lamoureux N., Latendre-Paquette J., Lindemulder A., McNeil A., McFarland N., Montaner J., Morrisseau C., O'Neill R., Page G., Piche A., Pongracz B., Preziosi H., Puri L., Rachlis A., Ralph E., Raymond I., Rouleau D., Routy J.P., Sandre R., Seddon T., Shafran S., Sikora C., Smaill F., Stromberg D., Trottier S., Walmsley S., Weiss K., Williams K., Zarowny D., Baadegaard B., Andersen Å.B., Boedker K., Collins P., Gerstoft J., Jensen L., Moller H., Andersen P.L., Loftheim I., Mathiesen L., Nielsen H., Obel N., Pedersen C., Petersen D., Jensen L.P., Black F.T., Aboulker J.P., Aouba A., Bensalem M., Berthe H., Blanc C., Bornarel D., Bouchaud O., Boue F., Bouvet E., Brancon C., Breaud S., Brosseau D., Brunet A., Capitant C., Ceppi C., Chakvetadze C., Cheneau C., Chennebault J.M., De Truchis P., Delavalle A.M., Delfraissy J.F., Dellamonica P., Dumont C., Edeb N., Fabre G., Ferrando S., Foltzer A., Foubert V., Gastaut J.A., Gerbe J., Girard P.M., Goujard C., Hoen B., Honore P., Hue H., Hynh T., Jung C., Kahi S., Katlama C., Lang J.M., Le Baut V., Lefebvre B., Leturque N., Lévy Y., Loison J., Maddi G., Maignan A., Majerholc C., De Boever C., Meynard J.L., Michelet C., Michon C., Mole M., Netzer E., Pialoux G., Poizot-Martin I., Raffi F., Ratajczak M., Ravaux I., Reynes J., Salmon-Ceron D., Sebire M., Simon A., Tegna L., Tisne-Dessus D., Tramoni C., Viard J.P., Vidal M., Viet-Peaucelle C., Weiss L., Zeng A., Zucman D., Adam A., Arastéh K., Behrens G., Bergmann F., Bickel M., Bittner D., Bogner J., Brockmeyer N., Darrelmann N., Deja M., Doerler M., Esser S., Faetkenheuer G., Fenske S., Gajetzki S., Goebel F., Gorriahn D., Harrer E., Harrer T., Hartl H., Hartmann M., Heesch S., Jakob W., Jäger H., Klinker H., Kremer G., Ludwig C., Mantzsch K., Mauss S., Meurer A., Niedermeier A., Pittack N., Plettenberg A., Potthoff A., Probst M., Rittweger M., Rockstroh J., Ross B., Rotty J., Rund E., Ruzicka T., Schmidt R., Schmutz G., Schnaitmann E., Schuster D., Sehr T., Spaeth B., Staszewski S., Stellbrink H.J., Stephan C., Stockey T., Stoehr A., Trein A., Vaeth T., Vogel M., Wasmuth J., Wengenroth C., Winzer R., Wolf E., Mulcahy F., Reidy D., Cohen Y., Drora G., Eliezer I., Godo O., Kedem E., Magen E., Mamorsky M., Pollack S., Sthoeger Z., Vered H., Yust I., Aiuti F., Bechi M., Bergamasco A., Bertelli D., Bruno R., Butini L., Cagliuso M., Carosi G., Casari S., Chrysoula V., Cologni G., Conti V., Costantini A., Corpolongo A., D'Offizi G., Gaiottino F., Di Pietro M., Esposito R., Filice G., Francesco M., Gianelli E., Graziella C., Magenta L., Martellotta F., Maserati R., Mazzotta F., Murdaca G., Nardini G., Nozza S., Puppo F., Pogliaghi M., Ripamonti D., Ronchetti C., Rusconi S., Rusconi V., Sacchi P., Silvia N., Suter F., Tambussi G., Uglietti A., Vechi M., Vergani B., Vichi F., Vitiello P., Iwamoto A., Kikuchi Y., Miyazaki N., Mori M., Nakamura T., Odawara T., Oka S., Shirasaka T., Tabata M., Takano M., Ueta C., Watanabe D., Yamamoto Y., Erradey I., Himmich H., El Filali K.M., Blok W., Van Boxtel R., Doevelaar K.B.H., Van Eeden A., Grijsen M., Groot M., Juttmann J., Kuipers M., Ligthart S., Van Der Meulen P., Lange J., Langebeek N., Reiss P., Richter C., Schoemaker M., Schrijnders-Gudde L., Septer-Bijleveld E., Sprenger H., Vermeulen J., Ten Kate R., Van De Ven B., Bruun J., Kvale D., Maeland A., Bakowska E., Beniowski M., Boron-Kaczmarska A., Gasiorowski J., Horban A., Inglot M., Knysz B., Mularska E., Parczewski M., Pynka M., Rymer W., Szymczak A., Aldir M., Antunes F., Baptista C., Da Conceicao Vera J., Doroana M., Mansinho K., Dos Santos C.R.A., Valadas E., Vaz Pinto I., Chia E., Foo E., Karim F., Lim P.L., Panchalingam A., Quek A., Alcázar-Caballero R., Arribas J., Arrizabalaga J., De Barron X., Blanco F., Bouza E., Bravo I., Calvo S., Carbonero L., Carpena I., Castro M., Cortes L., Del Toro M., Domingo P., Elias M., Espinosa J., Estrada V., Fernandez-Cruz E., Fernández P., Freud H., Fuster M., Garcia A., Garcia G., Garrido R., Gijón P., Gonzalez-García J., Gil I., González A., González-Lahoz J., Grosso P.L., Gutierrez M., Guzmán E., Iribarren J., Jiménez M., Jou A., Juega J., Lopez J., Lozano F., Martín-Carbonero L., Mata R., Mateo G., Menasalvas A., Mirelles C., De Miguel Prieto J., Montes M., Moreno A., Moreno J., Moreno V., Muñoz R., Ocampo A., Ortega E., Ortiz L., Padilla B., Parras A., Paster A., Pedreira J., Peña J., Perea R., Portas B., Puig J., Pulido F., Rebollar M., De Rivera J., Roca V., Rodríguez-Arrondo F., Rubio R., Santos J., Sanz J., Sebastian G., Segovia M., Soriano V., Tamargo L., Viciana P., Von Wichmann M., Bratt G., Hollander A., Olov Pehrson P., Petz I., Sandstrom E., Sönnerborg A., Bernasconi E., Gurtner V., Ampunpong U., Auchieng C., Bowonwatanuwong C., Chanchai P., Chetchotisakd P., Chuenyan T., Duncombe C., Horsakulthai M., Kantipong P., Laohajinda K., Phanuphak P., Pongsurachet V., Pradapmook S., Ruxruntham K., Seekaew S., Sonjai A., Suwanagool S., Techasathit W., Ubolyam S., Wankoon J., Alexander I., Dockrell D., Easterbrook P., Edwards B., Evans E., Fisher M., Fox R., Gazzard B., Gilleran G., Hand J., Heald L., Higgs C., Jebakumar S., Jendrulek I., Johnson S., Kinghorn G., Kuldanek K., Leen C., Maw R., McKernan S., McLean L., Morris S., Murphy M., O'Farrell S., Ong E., Peters B., Stroud C., Wansbrough-Jones M., Weber J., White D., Williams I., Wiselka M., Yee T., Adams S., Allegra D., Andrews L., Aneja B., Anstead G., Arduino R., Artz R., Bailowitz J., Banks S., Baxter J., Baum J., Benator D., Black D., Boh D., Bonam T., Brito M., Brockelman J., Bruzzese V., Burnside A., Cafaro V., Casey K., Cason L., Childress G., Clark C., Clifford D., Climo M., Cohn D., Couey P., Cuervo H., Deeks S., Dennis M., Diaz-Linares M., Dickerson D., Diez M., Di Puppo J., Dodson P., Dupre D., Elion R., Elliott K., El-Sadr W., Estes M., Fabre J., Farrough M., Flamm J., Follansbee S., Foster C., Frank C., Franz J., Frechette G., Freidland G., Frische J., Fuentes L., Funk C., Geisler C., Genther K., Giles M., Goetz M., Gonzalez M., Graeber C., Graziano F., Grice D., Hahn B., Hamilton C., Hassler S., Henson A., Hopper S., John M., Johnson L., Johnson R., Jones R., Kahn J., Klimas N., Kolber M., Koletar S., Labriola A., Larsen R., Lasseter F., Lederman M., Ling T., Lusch T., MacArthur R., Machado C., Makohon L., Mandelke J., Mannheimer S., Markowitz N., Martínez M., Martinez N., Mass M., Masur H., McGregor D., McIntyre D., McKee J., McMullen D., Mettinger M., Middleton S., Mieras J., Mildvan D., Miller P., Miller T., Mitchell V., Mitsuyasu R., Moanna A., Mogridge C., Moran F., Murphy R., Mushatt D., Nahass R., Nixon D., O'Brien S., Ojeda J., Okhuysen P., Olson M., Osterberger J., Owen W., Pablovich S., Sr., Patel S., Pierone G., Poblete R., Potter A., Preston E., Rappoport C., Regevik N., Reyelt M., Riney L., Rodriguez-Barradas M., Rodriguez J., Roland R., Rosmarin-DeStefano C., Rossen W., Rouff J., Saag M., Santiago S., Sarria J., Wirtz S., Schmidt U., Scott C., Sheridan A., Shin A., Shrader S., Simon G., Slowinski D., Smith K., Spotkov J., Sprague C., States D., Suh C., Sullivan J., Summers K., Sweeton B., Tan V., Tanner T., Tedaldi E., Temesgen Z., Thomas D., Thompson M., Tobin C., Toro N., Towner W., Upton K., Uy J., Valenti S., Van Der Horst C., Vita J., Voell J., Walker J., Walton T., Wason K., Watson V., Wellons A., Weise J., White M., Whitman T., Williams B., Williams N., Windham J., Witt M., Workowski K., Wortmann G., Wright T., Zelasky C., Zwickl B., Dietz D., Chesson C., Vjecha M., Schmetter B., Grue L., Willoughby M., Demers A., Lundgren J.D., Dragsted U.B., Jensen K.B., Jansson P.O., Jensen B.G., Benfield T.L., Darbyshire J.H., Babiker G., Fleck S.L., Collaco-Moraes Y., Wyzydrag L., Drummond F.M., Connor S.A., Satchell C.S., Gunn S., Delfino M.A., Merlin K., McGinley C., Neaton J.D., Bartsch G., George M., Grund B., Hogan C., Miller C., Roediger M.P., Thackeray L., Campbell C., Lahart C., Perlman D., Rein M., DerSimonian R., Brody B.A., Daar E.S., Dubler N.N., Fleming T.R., Freeman D.J., Kahn J.P., Kim K.M., Medoff G., Modlin J.F., Moellering R., Murray B.E., Robb M.L., Scharfstein D.O., Sugarman J., Tsiatis A., Tuazon C., Zoloth L., Klingman K., Lehrman S., Belloso W.H., Losso M.H., Benetucci J.A., Bogdanowicz E.P., Cahn P.E., Casiró A.D., Cassetti I., Contarelli J.M., Corral J.A., Crinejo A., David D.O., Ishida M.T., Laplume H.E., Lasala M.B., Lupo S.H., Masciottra F., Michaan M., Ruggieri L., Salazar E., Sánchez M., Hoy J.F., Rogers G.D., Allworth A.M., Anderson J.S.C., Armishaw J., Barnes K., Carr A., Chiam A., Chuah J.C.P., Curry M.C., Dever R.L., Donohue W.A., Doong N.C., Dwyer D.E., Dyer J., Eu B., Ferguson V.W., French M.A.H., Garsia R.J., Hudson J.H., Jeganathan S., Konecny P., McCormack C.L., McMurchie M., Moore R.J., Moussa M.B., Piper M., Read T., Roney J.J., Shaw D.R., Silvers J., Smith D.J., Street A.C., Vale R.J., Wendt N.A., Wood H., Youds D.W., Zillman J., Tozeau V., Dewit S., De Roo A., Leonard P., Lynen L., Moutschen M., Pereira L.C., Souza T.N.L., Schechter M., Zajdenverg R., Almeida M.M.T.B., Araujo F., Bahia F., Brites C., Caseiro M.M., Casseb J., Etzel A., Falco G.G., Filho E.C.J., Flint S.R., Gonzales R., Madruga J.V.R., Passos L.N., Reuter T., Sidi L.C., Toscano A.L.C., Cherban E., Conway B., Dufour C., Foster A., Haase D., Haldane H., Klein M., Lessard B., Martel A., Martel C., Paradis E., Schlech W., Schmidt S., Thompson B., Vezina S., Reyes M.J.W., Northland R., Ostergaard L., Hergens L., Loftheim I.R., Raukas M., Zilmer K., Justinen J., Ristola M., Landman R., Abel S., Abgrall S., Amat K., Auperin L., Barruet R., Benalycherif A., Benammar N., Bentata M., Besnier J.M., Blanc M., Cabié A., Chavannet P., Dargere S., De La Tribonniere X., Debord T., Decaux N., Delgado J., Dupon M., Durant J., Frixon-Marin V., Genet C., Gérard L., Gilquin J., Jeantils V., Kouadio H., Leclercq P., Lelièvre J.D., Levy Y., Michon C.P., Nau P., Pacanowski J., Piketty C., Salmon D., Schmit J.L., Serini M.A., Tassi S., Touam F., Verdon R., Weinbreck P., Yazdanpanah Y., Yeni P., Fätkenheuer G., Bitsch S., Bogner J.R., Goebel F.D., Lehmann C., Lennemann T., Wasmuth J.C., Wiedemeyer K., Hatzakis A., Touloumi G., Antoniadou A., Daikos G.L., Dimitrakaki A., Gargalianos-Kakolyris P., Giannaris M., Karafoulidou A., Katsambas A., Katsarou O., Kontos A.N., Kordossis T., Lazanas M.K., Panagopoulos P., Panos G., Paparizos V., Papastamopoulos V., Petrikkos G., Sambatakou H., Skoutelis A., Tsogas N., Xylomenos G., Bergin C.J., Mooka B., Mamorksy M.G., Agmon-Levin N., Karplus R., Maayan S., Shahar E., Turner D., Abeli C., Biglino A., Bonora S., De Gioanni M., Di Perri G., Montroni M., Quirino T., Raise E., Honda M., Ishisaka M., Caplinskas S., Uzdaviniene V., Schmit J.C., Staub T., Mills G.D., Blackmore T., Masters J.A., Morgan J., Pithie A., Brunn J., Ormassen V., La Rosa A., Guerra O., Espichan M., Gutierrez L., Mendo F., Salazar R., Knytz B., Kwiatkowski J., Castro R.S., Horta A., Miranda A.C., Pinto I.V., Vera J., Rakhmanova A., Vinogradova E., Yakovlev A., Zakharova N., Wood R., Orrel C., Arnaiz J.A., Carrillo R., Dalmau D., Jordano Q., Knobel H., Larrousse M., Moreno J.S., Oretaga E., Pena J.N., Hirschel B., Spycher R., Battegay M., Bottone S., Cavassini M., Christen A., Furrer H.J., Gayet-Ageron A., Genné D., Hochstrasser S., Moens C., Müller N., Nüesch R., Ruxrungtham K., Pumpradit W., Dangthongdee S., Kiertiburanakul S., Klinbuayaem V., Mootsikapun P., Nonenoy S., Piyavong B., Prasithsirikul W., Raksakulkarn P., Gazzard B.G., Ainsworth J.G., Angus B.J., Barber T.J., Brook M.G., Care C.D., Chadwick D.R., Chikohora M., Churchill D.R., Cornforth D., Dockrell D.H., Easterbrook P.J., Fox P.A., Gomez P.A., Gompels M.M., Harris G.M., Herman S., Jackson A.G.A., Jebakumar S.P.R., Kinghorn G.R., Kuldanek K.A., Larbalestier N., Lumsden M., Maher T., Mantell J., Muromba L., Orkin C.M., Peters S., Peto T.E.A., Portsmouth S.D., Rajamanoharan S., Ronan, Schwenk A., Slinn M.A., Stroud C.J., Thomas R.C., Wansbrough-Jones M.H., Whiles H.J., White D.J., Williams E., Williams G., Youle M., Abrams D.I., Acosta E.A., Adamski A., Antoniskis D., Aragon D.R., Barnett B.J., Baroni C., Barron M., Baxter J.D., Beers D., Beilke M., Bemenderfer, Bernard A., Besch C.L., Bessesen M.T., Bethel J.T., Blue S., Blum J.D., Boarden S., Bolan R.K., Borgman J.B., Brar I., Braxton B.K., Bredeek U.F., Brennan R., Britt D.E., Bulgin-Coleman D., Bullock E., Campbell B., Caras S., Carroll J., Casey K.K., Chiang F., Cindrich R.B., Cohen C., Coley J., Condoluci D.V., Contreras R., Corser J., Cozzolino J., Crane L.R., Daley L., Dandridge D., D'Antuono V., Darcourt Rizo Patron J.G., DeHovitz J.A., DeJesus E., DesJardin J., Dietrich C., Dolce A., Erickson D., Faber L.L., Falbo J., Farrough M.J., Farthing C.F., Ferrell-Gonzalez P., Flynn H., Frank M., Freeman K.F., French N., Friedland G., Fujita N., Gahagan L., Gilson I., Goetz M.B., Goodwin E., Guity C.K., Gulick P., Gunderson E.R., Hale C.M., Hannah K., Henderson H., Hennessey K., Henry W.K., Higgins T., Hodder S.L., Horowitz H.W., Howe-Pittman M., Hubbard J., Hudson R., Hunter H., Hutelmyer C., Insignares M.T., Jackson L., Jenny L., Johnson D.L., Johnson G., Johnson J., Kaatz J., Kaczmarski J., Kagan S., Kantor C., Kempner T., Kieckhaus K., Kimmel N., Klaus B.M., Koeppe J.R., Koirala J., Kopka J., Kostman J.R., Kozal M.J., Kumar A., Lampiris H., Lamprecht C., Lattanzi K.M., Lee J., Leggett J., Long C., Loquere A., Loveless K., Lucasti C.J., Luskin-Hawk R., MacVeigh M., Makohon L.H., Markowitz N.P., Marks C., Martorell C., McFeaters E., McGee B., McIntyre D.M., McManus E., Melecio L.G., Melton D., Mercado S., Merrifield E., Mieras J.A., Mogyoros M., Moran F.M., Murphy K., Mutic S., Nadeem I., Nadler J.P., Ognjan A., O'Hearn M., O'Keefe K., Okhuysen P.C., Oldfield E., Olson D., Orenstein R., Ortiz R., Parpart F., Pastore-Lange V., Paul S., Pavlatos A., Pearce D.D., Pelz R., Peterson S., Pitrak D., Powers S.L., Pujet H.C., Raaum J.W., Ravishankar J., Reeder J., Reilly N.A., Reyelt C., Riddell J., IV, Rimland D., Robinson M.L., Rodriguez A.E., Rodriguez Derouen V., Rosmarin C., Rossen W.L., Rouff J.R., Sands M., Savini C., Schrader S., Schulte M.M., Scott R., Seedhom H., Sension M., ShebleHall A., Shuter J., Slater L.N., Slotten R., Smith M., Snap S., States D.M., Stringer G., Summers K.K., Swanson K., Sweeton I.B., Szabo S., Tedaldi E.M., Telzak E.E., Thompson M.A., Thompson S., Bong C.T.H., Vaccaro A., Vasco L.M., Vecino I., Verlinghieri G.K., Visnegarwala F., Wade H., Weis S.E., Weise J.A., Weissman S., Wilkin M., Witter J.H., Wojtusic L., Wright T.J., Yeh V., Young B., Zeana C., Zeh J., Savio E., Vacarezza M.
• Other Authors: MEDICINE
• Format: Article
• Published: Public Library of Science 2018
• Online Access: http://scholarbank.nus.edu.sg/handle/10635/142924
• Institution: National University of Singapore

10.1371/journal.pone.0139981